Epidemiologia molecular de Escherichia coli resistentes a antimicrobianos de importância clínica isoladas de gambás (Didelphis spp.) resgatados em centro de manejo de fauna silvestre na cidade de São Paulo

• Processo: 24/17243-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2025
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2029
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Medicina Veterinária - Medicina Veterinária Preventiva
• Pesquisador responsável: Marcos Bryan Heinemann
• Beneficiário: Gabriel Siqueira dos Santos
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia (FMVZ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia computacional Genômica Vigilância epidemiológica Bacteriologia veterinária
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Enterobactereceae | Genômica | Vigilância Epidemiológica | Bacteriologia veterinária

Resumo

A crescente ameaça da resistência bacteriana a antimicrobianos (AMR) apresenta graves implicações para a saúde pública e a economia global. Animais sinantrópicos silvestres, como gambás (Didelphis spp.), podem atuar como reservatórios e disseminadores de bactérias multidroga-resistentes, especialmente em ambientes antropomorfizados. Este projeto visa caracterizar fenotipicamente e genotipicamente estirpes de Escherichia coli isoladas de gambás no município de São Paulo quanto a suscetibilidade a antimicrobianos além de realizar análises filogenômicas e fazer georreferenciamento dos isolados. Serão coletadas amostras de suabes de pseudoclaca e fezes de gambás atendidos e resgatados pelo Centro de Manejo e Conservação de Animais Silvestres (CEMACAS) da Prefeitura de São Paulo, para cultura, isolamento e identificação de estirpes de Escherichia coli no Laboratório de Zoonoses Bacterianas da Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da Universidade de São Paulo. As estirpes serão submetidas a testes de suscetibilidade a antimicrobianos por disco-difusão e microdiluição em caldo, e serão pesquisados genes codificadores de mecanismos de resistência: betalactamases de espectro estendido (ESBL) (blaCTX-M grupo 1, blaCTX-M grupo 2, blaCTX-M grupo 8, blaCTX-M grupo 9, blaTEM e blaSHV), carbapenemases (blaKPC, blaOXA-48-like, blaNDM), resistência mobilizada a colistina (MCR) (mcr-1, mcr-2, mcr-3, mcr-4, mcr-5, mcr-6, mcr-7, mcr-8, mcr-9) e resistência a quinolonas mediadas por plasmídeos (PMQR) (qnrA, qnrB, qnrS, oqxB, oqxA, qepA e aac(6)-Ib). Os isolados serão tipificados em filogrupos (A, B1, B2, C, D, E, F e G) e por polimorfismo de comprimento de fragmento amplificado de enzima única (SE-AFLP), seguidos de sequenciamento de genoma completo para análise de resistoma, viruloma, mobiloma e plasmidoma. Serão feitas análises estatísticas descritivas sobre o perfil fenotípico e genotípico de AMR, filogrupos, genótipos dos isolados bacterianos e testes estatísticos de associação para correlacionar perfis fenotípicos e gentotípicos de AMR e as regiões de resgate dos animais.