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Caracterizacao global do perfil de expressao genica dos estagios inicial e avancado do melanoma e analise funcional de candidatos a supressor de tumor ou oncogene:consolidando ferramentas e dados...

Processo: 07/50604-9
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de maio de 2007
Data de Término da vigência: 15 de janeiro de 2010
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Enilza Maria Espreafico
Beneficiário:Josane de Freitas Sousa
Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Assunto(s):Oncogenes   Expressão gênica diferencial   Melanoma   Progressão tumoral
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Expressao Diferencial | Melanoma | Oncogenes | Progressao Tumoral | Silenciamento Genico Por Rnai | Supressores De Tumor

Resumo

Dados prévios, resultantes da utilização de microarranjos contendo cDNA ORESTES cujas seqüências mapeiam em regiões cromossômicas associadas ao desenvolvimento do melanoma, revelaram 4 novos genes com potencial envolvimento na progressão tumoral. Além disso, foram geradas duas bibliotecas subtrativas, cuja análise inicial (20% dos clones) indicou representarem duas coleções de genes com marcante expressão diferencial entre os estágios de crescimento radial e metastático do melanoma. Assim, pretendemos definir e caracterizar o papel desempenhado pelos genes identificados no desenvolvimento do melanoma e ampliar as análises de expressão gênica diferencial. Para isso propomos: 1. seqüenciar completamente as bibliotecas subtrativas; 2. realizar análises in silico das seqüências para melhor definição de candidatos a marcadores diagnóstico/prognóstico ou terapia direcionada; 3. confirmar por Northern blotting e Real-Time RT-PCR, o perfil de expressão diferencial dos genes candidatos selecionados em linhagens celulares e amostras tumorais; 4. causar interferência funcional, através da técnica de RNAi, sobre os genes selecionados. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
SOUSA, JOSANE F.; TORRIERI, RAUL; SILVA, RODRIGO R.; PEREIRA, CRISTIANO G.; VALENTE, VALERIA; TORRIERI, ERICO; PERONNI, KAMILA C.; MARTINS, WALESKA; MUTO, NAIR; FRANCISCO, GUILHERME; et al. Novel Primate-Specific Genes, RMEL 1, 2 and 3, with Highly Restricted Expression in Melanoma, Assessed by New Data Mining Tool. PLoS One, v. 5, n. 10, . (07/50604-9, 06/60328-6, 08/56521-0, 05/60026-7, 07/57307-0)