Organização genômica e expressão do gene araXPB em Arabidopsis thaliana

• Processo: 98/00004-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 1998
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2002
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Marie-Anne Van Sluys
• Beneficiário: Patrícia Gleydes Morgante
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Arabidopsis Thaliana | Gene Xpb | Helicase De Dna | Luz Uv | Reparo De Dna | Transcricao De Dna

Resumo

O cDNA araXPB de Arabidopsis thaliana foi isolado graças à sua homologia com o gene XPB, que desempenha importante função na transcrição e no reparo de DNA em células humanas. O alinhamento da proteína araXPB às proteínas homólogas de levedura e humana revelou alto grau de identidade e similaridade, bem como a presença de todos os domínios funcionais encontrados nestas duas proteínas. Tais resultados sugerem fortemente que o gene araXPB deva atuar na transcrição e no reparo de DNA em plantas, sendo sua identificação a primeira evidência molecular do reparo por excisão de nucleotídeos em vegetais superiores. Logo, o estudo do papel do gene araXPB no organismo vegetal é de fundamental importância para a compreensão do metabolismo de DNA em plantas e para o estabelecimento das bases moleculares do reparo por excisão de nucleotídeos nestes organismos. Nesse contexto insere-se o objetivo geral do presente projeto, que destina-se ao estudo da organização genômica e do padrão de expressão do gene araXPB em diferentes variedades de A. thaliana, a saber, Benshein, Columbia e Landsberg. Inicialmente, será realizado o isolamento do clone genômico para localização do promotor e da posição dos introns a partir de uma biblioteca genômica de Landsberg e, será estudado o grau de conservação do gene nos três ecotipos, baseando-se no padrão de restrição do DNA genômico através de análises por "Southern blot". Em paralelo, a expressão do gene será estudada nos órgãos de plantas em diferentes fases de desenvolvimento e submetidas a diferentes condições de crescimento. Tais análises serão conduzidas através de "Northern blot", para visualização do mRNA e, através de "Westhern blot" e imunolocalização, para detecção da proteína. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

MASUDA, HANA PAULA; NAKABASHI, MYNA; MORGANTE, PATRICIA G.; KAJIHARA, DANIELA; DE SETTA, NATHALIA; MARTINS MENCK, CARLOS FREDERICO; VAN SLUYS, MARIE-ANNE. Evidence for sub-functionalization of tandemly duplicated XPB nucleotide excision repair genes in Arabidopsis thaliana. Gene, v. 754, SEP 5 2020. (05/56548-8, 06/61559-1, 14/15982-6, 09/52417-7, 98/00004-4, 02/02655-0, 98/03925-3)