Genes diferencialmente expressos no timo de camundongos portadores de tumor avaliados por cdna-microarrays.

• Processo: 02/14098-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2003
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2006
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Imunologia - Imunogenética
• Pesquisador responsável: Geraldo Aleixo da Silva Passos Júnior
• Beneficiário: Márcia Maria Chiquitelli Marques Silveira
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 99/12135-9 - Projeto transcriptoma: análise da expressão gênica em larga escala usando DNA-arrays, AP.TEM
• Assunto(s): Transcriptoma Análise de sequência com séries de oligonucleotídeos Neoplasias Expressão gênica Timo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cancer | Expressao Genica | Microarrays | Oncogene Ha-Ras | Timo | Transcriptoma

Resumo

Este projeto visa avaliar a possibilidade de estabelecermos uma relação entre perfis de expressão gênica do timo com a evolução do crescimento tumoral in vivo. Para isto acompanharemos o crescimento tumoral in vivo do fibrossarcoma B61 (fibroblastos Balb/3T3 transfectados com o oncogene HA-ras), em camundongos e traçaremos curvas de crescimento tumoral. Dos camundongos portadores de tumor B61, prepararemos RNA total do timo, cujas amostras serão convertidas em cDNA total marcado com 33P(sonda complexa). As sondas complexas, provenientes de animais em diferentes fases do crescimento tumoral, serão hibridadas com um conjunto de microarrays em nylon, contendo um total de 1576 seqüências alvo de cDNAs. As imagens de hibridação serão conseguidas num aparelho leitor de fósforo (Packard Inst. USA) e os pontos quantificados com auxílio do software Array Vision R (Affymetrix) analisados com o software Spot FireR (Affymetrix) que nos permite agrupar os genes expressos segundo os níveis de expressão. Este projeto prevê a organização de dendogremas constando níveis de expressão, no timo, das diferentes seqüências analisadas em relação ao crescimento tumoral. (AU)