Estudos estruturais das interações dos receptores dos hormônios tireoideanos com os seus elementos responsivos do DNA

• Processo: 02/14041-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2003
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2008
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Igor Polikarpov
• Beneficiário: Mario de Oliveira Neto
• Instituição Sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 99/03387-4 - Estudos estruturais de proteínas usando luz síncrotron, AP.TEM
• Assunto(s): Hormônios tireóideos Receptores citoplasmáticos e nucleares Elementos estruturais de proteínas Cristalografia de proteínas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cristalorafia De Proteinas | Estudos Estruturais | Receptores Nucleares

Resumo

Neste projeto nos propomos a expandir o estado-da-arte na área de estrutura de receptores nucleares e determinar a base estrutural da interação específica entre TR e DNA. Mais especificamente pretendemos utilizar a técnica de cristalografia de proteínas, bem como espalhamento de raios-X a baixo ângulo, para estudar interações do receptor tireoideano humano (hTR) com seus elementos responsivos. Vamos nos concentrar primeiramente nas tentativas de co-cristalizar TR DBDs com os elementos responsivos F2, TREpal e DR-4. Tendo em vista o sucesso na cristalização do TR DBD junto com RXR DBD ligados ao elemento responsivo DR-4, este objetivo promete ser mais facilmente alcançado. Pretendemos também fazer esforços para cristalizar o TR completo ou TR DBD-LBD junto com os elementos responsivos acima mencionados. Em paralelo com os experimentos cristalográficos, pretendemos conduzir os estudos do TR junto com os TREs DR-4, F2 e TREpal em solução usado a técnica de SAXS. É importante ressaltar que o entendimento do funcionamento dos receptores nucleares tem enorme importância científica e aplicada, e não será completo, sem que se entendam as interações destes com o DNA. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

GARCIA, WANIUS; FIGUEIRA, ANA CAROLINA M.; NETO, MARIO DE OLIVEIRA; DE GUZZI, CAROLINA A.; BUZZA, HILDE H.; PORTUGAL, RODRIGO V.; CALGARO, MARCOS R.; POLIKARPOV, IGOR. Probing conformational changes in orphan nuclear receptor: The NGFI-B intermediate is a partially unfolded dimer. Biophysical Chemistry, v. 137, n. 2-3, p. 81-87, OCT 2008. (02/14041-6, 03/09462-5, 06/00182-8)

CALGARO, MARCOS R.; OLIVEIRA NETO, MARIO DE; FIGUEIRA, ANA CAROLINA M.; SANTOS, MARIA A. M.; PORTUGAL, RODRIGO V.; GUZZI, CAROLINA A.; SAIDEMBERG, DANIEL M.; BLEICHER, LUCAS; VERNAL, JAVIER; FERNANDEZ, PABLO; et al. Orphan nuclear receptor NGFI-B forms dimers with nonclassical interface. Protein Science, v. 16, n. 8, p. 1762-1772, Aug. 2007. (02/14041-6, 02/05329-6)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

OLIVEIRA NETO, Mario de. Espalhamento de raios-X a baixo ângulo aplicado ao estudo estrutural de proteínas. 2008. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Física de São Carlos (IFSC/BT) São Carlos.