Identificação, caracterização e aspectos evolutivos dos vírus transmitidos por Brevipalpus que causam a leprose dos citros

Autor(es)

Camila Chabí de Jesus

• Tipo de documento: Tese de Doutorado
• Imprenta: Piracicaba.
• Instituição: Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC)
• Data de defesa: 2020-12-01

Membros da banca

Juliana de Freitas Astúa; José Evando Aguiar Beserra Junior; Marcelo Eiras; Francisco Murilo Zerbini Junior

• Orientador: Juliana de Freitas Astúa; Pedro Luis Ramos González

Resumo

A leprose dos citros (LC) é uma doença não sistêmica que afeta os pomares de citros principalmente na América Latina. Transmitida por ácaros Brevipalpus, a doença é causada por um grupo heterogêneo de vírus dos gêneros Cilevirus (família Kitaviridae) e Dichorhavirus (família Rhabdoviridae), conhecidos coletivamente como vírus transmitidos por Brevipalpus (VTBs). Descrita pela primeira vez na Flórida/EUA, no final do século 19, a LC foi detectada na década de 1930 no Brasil, Argentina e Paraguai e mais recentemente em diversos países latino-americanos. A LC prevalente é causada pelo cilevirus citrus leprosis virus C (CiLV-C) e em menor extensão por outros VTBs cuja diversidade molecular ainda não foi bem compreendida. O presente estudo teve como objetivo descrever detalhadamente a população de CiLV-C e caracterizar três novos dichorhavirus que causam a LC. Para as análises da população de CiLV-C, examinamos um conjunto de 425 amostras sintomáticas de citrus coletadas na América Latina no período de 1932-2019, incluindo oito amostras herborizadas conservadas por mais de 80 anos. Análises de diversidade e filogenia indicaram que a população do CiLV-C é subdividida em três linhagens, denominadas CRD, SJP e ASU, cujos membros apresentam sinais de processos de recombinação interclados. Membros do clado CRD foram identificados amplamente no subcontinente desde 1932, enquanto os do clado SJP foram restritos a pomares comerciais no cinturão citrícola de São Paulo-Minas Gerais, em amostras coletadas após 2015. A linhagem ASU é representada por apenas um isolado coletado em Assunção, Paraguai, em 1937, e a diversidade e distribuição dos atuais membros, se houver, ainda são desconhecidas. O ancestral comum mais recente das três linhagens provavelmente originou-se em contato com a vegetação nativa em um ecossistema selvagem da América do Sul, antes da introdução dos citros na América. As subpopulações atuais de CiLV-C são geneticamente bem diferenciadas, apresentam diversidade genética muito baixa, onde quase todos os haplótipos são únicos, e sob purificação. Três novas espécies de dichorhavirus foram identificadas em amostras de laranjeiras doce (Citrus sinensis) coletadas em pomares não comerciais ou em pequenos pomares de regiões distantes e climaticamente distintas do Brasil. Enquanto o citrus leprosis virus N (CiLV-N) e o citrus bright spot virus (CiBSV) foram detectados nas regiões Sul e Sudeste, o citrus chlorotic spot virus (CiCSV) foi encontrado na região Nordeste. Além de laranja doce, o CiCSV infecta naturalmente plantas das espécies Talipariti tiliaceum e Agave desmettiana. O CiLV-N é transmitido por ácaros da espécie Brevipalpus phoenicis s.s., que também provavelmente é o vetor do CiBSV. Por sua vez, o CiCSV é transmitido por B. yothersi, a espécie mais abundante em pomares de citros no Brasil e o principal vetor do CiLV-C, enquanto B. aff. yothersi, provavelmente uma nova espécie, também é capaz de transmiti-lo. Além de revelar a estrutura e as forças evolutivas que impulsionam a população de CiLV-C, este trabalho revela novos VTBs causadores da LC. Ademais, expõe um fragmento do cenário desafiador para o desenvolvimento da citricultura frente ao risco de saturação em áreas cultiváveis pelos vírus prevalentes e a ameaça dos supostos emergentes. (AU)

• Processo FAPESP: 16/01960-6 - Caracterização molecular, filogenia e evolução de vírus transmitidos por ácaros Brevipalpus spp. no Brasil
• Beneficiário: Camila Chabi de Jesus
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado