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Rede de proteoma do estado de São Paulo

Processo: 04/14846-0
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Programa GENOMA
Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2005
Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2010
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas
Pesquisador responsável:Fabio Cesar Gozzo
Beneficiário:Fabio Cesar Gozzo
Instituição Sede: Associação Brasileira de Tecnologia de Luz Síncrotron (ABTLuS). Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação (Brasil). Campinas , SP, Brasil
Assunto(s):Proteoma  Espectrometria de massas 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Proteoma | Respectrometria De Massas

Resumo

Após o desenvolvimento da área de genômica no Brasil, uma enorme quantidade de dados de sequência de DNA foi depositada para vários organismos de interesse científico e, acima de tudo, industrial. Dentre esses organismos encontram-se vários patógenos que tem relação direta com a área agrícola brasileira e, portanto, pode ter um grande impacto comercial. Uma vez montado o banco de dados de genoma, pode-se então começar a atuar em pesquisa que visam não agora os genes, mas sim proteínas, as reais efetoras de toda a bioquímica dos organismos. Com o desenvolvimento da área de espectrometria de massas, é possível hoje analisar proteínas com uma velocidade, sensibilidade e confiança nunca antes atingidas. Isto abriu a possibilidade da execução de projetos proteoma, onde o conjunto das proteínas de um organismo em um determinado estado pode ser determinado, fornecendo informações de grande valia. O presente projeto tem, portanto, o objetivo de realizar uma rede de estudos de proteoma dentro do estado de São Paulo a fim de se desenvolver esta área. Pretende-se utilizar as capacidades e as afinidades dos grupos de pesquisa que já atuam na área de proteínas para desenvolver recursos humanos capacitados na área de proteoma. (AU)

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Publicações científicas (20)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
IGLESIAS, AMADEU H.; SANTOS, LUIZ FERNANDO A.; GOZZO, FABIO C.. Identification of Cross-Linked Peptides by High-Resolution Precursor Ion Scan. Analytical Chemistry, v. 82, n. 3, p. 909-916, . (07/55930-1, 04/14846-0, 08/57805-2)
VIDOTTO, ALESSANDRA; HENRIQUE, TIAGO; RAPOSO, LUIZ SERGIO; MANIGLIA, JOSE VICTOR; TAJARA, ELOIZA H.. Salivary and serum proteomics in head and neck carcinomas: Before and after surgery and radiotherapy. CANCER BIOMARKERS, v. 8, n. 2, p. 95-107, . (04/14846-0)
VIDOTTO, ALESSANDRA; MORAIS, ANA T. S.; RIBEIRO, MILENE R.; PACCA, CAROLINA C.; TERZIAN, ANA C. B.; GIL, LAURA H. V. G.; MOHANA-BORGES, RONALDO; GALLAY, PHILIPPE; NOGUEIRA, MAURICIO L.. Systems Biology Reveals NS4B-Cyclophilin A Interaction: A New Target to Inhibit YFV Replication. JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, v. 16, n. 4, p. 1542-1555, . (09/01400-7, 04/14846-0, 10/05043-1)
GOMES, ALEXANDRE F.; GOZZO, FABIO C.. Chemical cross-linking with a diazirine photoactivatable cross-linker investigated by MALDI- and ESI-MS/MS. Journal of Mass Spectrometry, v. 45, n. 8, p. 892-899, . (04/14846-0, 08/57805-2)
TASHIMA, ALEXANDRE K.; ZELANIS, ANDRE; KITANO, EDUARDO S.; IANZER, DANIELLE; MELO, ROBSON L.; RIOLI, VANESSA; SANT'ANNA, SAVIO S.; SCHENBERG, ANA C. G.; CAMARGO, ANTONIO C. M.; SERRANO, SOLANGE M. T.. Peptidomics of Three Bothrops Snake Venoms: Insights Into the Molecular Diversification of Proteomes and Peptidomes. MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS, v. 11, n. 11, p. 1245-1262, . (04/14846-0, 07/54626-7, 98/14307-9, 11/10468-4, 09/15932-0)
BEREZNIUK, IRYNA; SIRONI, JUAN; CALLAWAY, MYRASOL B.; CASTRO, LEANDRO M.; HIRATA, IZAURA Y.; FERRO, EMER S.; FRICKER, LLOYD D.. CCP1/Nna1 functions in protein turnover in mouse brain: Implications for cell death in Purkinje cell degeneration mice. FASEB JOURNAL, v. 24, n. 6, p. 1813-1823, . (04/14846-0, 04/04933-2)
GELMAN, JULIA S.; SIRONI, JUAN; CASTRO, LEANDRO M.; FERRO, EMER S.; FRICKER, LLOYD D.. Hemopressins and other hemoglobin-derived peptides in mouse brain: comparison between brain, blood, and heart peptidome and regulation in Cpefat/fat mice. Journal of Neurochemistry, v. 113, n. 4, p. 871-880, . (04/14846-0, 04/04933-2)
IGLESIAS, AMADEU H.; SANTOS, LUIZ F. A.; GOZZO, FABIO C.. Collision-Induced Dissociation of Lys-Lys Intramolecular Crosslinked Peptides. JOURNAL OF THE AMERICAN SOCIETY FOR MASS SPECTROMETRY, v. 20, n. 4, p. 557-566, . (04/14846-0)
LEME‚ A.F.P.; KITANO‚ E.S.; FURTADO‚ M.F.; VALENTE‚ R.H.; CAMARGO‚ A.; HO‚ P.L.; FOX‚ J.W.; SERRANO‚ S.M.T.. Analysis of the subproteomes of proteinases and heparin-binding toxins of eight Bothrops venoms. PROTEOMICS, v. 9, n. 3, p. 733-745, . (04/14846-0, 98/14307-9, 06/60197-9, 04/15974-1)
GALLO, JOSE RENATO B.; MASCHIO-SIGNORINI, LARISSA B.; CABRAL, CELSO R. B.; DE CAMPOS ZUCCARI, DEBORA A. P.; NOGUEIRA, MAURICIO L.; BOZOLA, ANTONIO R.; CURY, PATRICIA M.; VIDOTTO, ALESSANDRA. Skin Protein Profile after Major Weight Loss and Its Role in Body Contouring Surgery. PLASTIC AND RECONSTRUCTIVE SURGERY-GLOBAL OPEN, v. 7, n. 8, . (04/14846-0)
VIDOTTO, ALESSANDRA; POLACHINI, GIOVANA M.; DE PAULA-SILVA, MARINA; OLIANI, SONIA M.; HENRIQUE, TIAGO; LOPEZ, ROSSANA V. M.; CURY, PATRICIA M.; NUNES, FABIO D.; GOIS-FILHO, JOSE F.; DE CARVALHO, MARCOS B.; et al. Differentially expressed proteins in positive versus negative HNSCC lymph nodes. BMC MEDICAL GENOMICS, v. 11, . (04/14846-0, 04/12054-9)
PAES LEME, ADRIANA F.; SHERMAN, NICHOLAS E.; SMALLEY, DAVID M.; SIZUKUSA, LETICIA O.; OLIVEIRA, ANA K.; MENEZES, MILENE C.; FOX, JAY W.; SERRANO, SOLANGE M. T.. Hemorrhagic Activity of HF3, a Snake Venom Metalloproteinase: Insights from the Proteomic Analysis of Mouse Skin and Blood Plasma. JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, v. 11, n. 1, p. 279-291, . (04/14846-0, 06/50059-8, 98/14307-9, 04/15974-1)
WARDMAN, JONATHAN H.; ZHANG, XIN; GAGNON, SANDRA; CASTRO, LEANDRO M.; ZHU, XIAORONG; STEINER, DONALD F.; DAY, ROBERT; FRICKER, LLOYD D.. Analysis of peptides in prohormone convertase 1/3 null mouse brain using quantitative peptidomics. Journal of Neurochemistry, v. 114, n. 1, p. 215-225, . (04/14846-0, 04/04933-2)
OLIVEIRA, ANA K.; PAES LEME, ADRIANA F.; ASSAKURA, MARINA T.; MENEZES, MILENE C.; ZELANIS, ANDRE; TASHIMA, ALEXANDRE K.; LOPES-FERREIRA, MONICA; LIMA, CARLA; CAMARGO, ANTONIO C. M.; FOX, JAY W.; et al. Simplified procedures for the isolation of HF3, bothropasin, disintegrin-like/cysteine-rich protein and a novel P-I metalloproteinase from Bothrops jararaca venom. Toxicon, v. 53, n. 7-8, p. 797-801, . (04/14846-0, 98/14307-9, 04/15974-1)
ZELANIS, ANDRE; TASHIMA, ALEXANDRE K.; PINTO, ANTONIO F. M.; LEME, ADRIANA F. PAES; STUGINSKI, DANIEL R.; FURTADO, MARIA F.; SHERMAN, NICHOLAS E.; HO, PAULO L.; FOX, JAY W.; SERRANO, SOLANGE M. T.. Bothrops jararaca venom proteome rearrangement upon neonate to adult transition. PROTEOMICS, v. 11, n. 21, p. 4218-4228, . (04/14846-0, 07/54626-7, 98/14307-9)
SANTOS, LUIZ F. A.; IGLESIAS, AMADEU H.; GOZZO, FABIO C.. Fragmentation features of intermolecular cross-linked peptides using N-hydroxy-succinimide esters by MALDI- and ESI-MS/MS for use in structural proteomics. Journal of Mass Spectrometry, v. 46, n. 8, p. 742-750, . (07/55930-1, 04/14846-0, 08/57805-2)
PILAU, EDUARDO J.; IGLESIAS, AMADEU H.; GOZZO, FABIO C.. A new label-free approach for the determination of reaction rates in oxidative footprinting experiments. ANALYTICAL AND BIOANALYTICAL CHEMISTRY, v. 405, n. 24, p. 7679-7686, . (04/14846-0, 08/57805-2)
RODRIGUES-LISONI, FLAVIA C.; PEITL, JR., PAULO; VIDOTTO, ALESSANDRA; POLACHINI, GIOVANA M.; MANIGLIA, JOSE V.; CARMONA-RAPHE, JULIANA; CUNHA, BIANCA R.; HENRIQUE, TIAGO; SOUZA, CAIQUE F.; TEIXEIRA, RODRIGO A. P.; et al. Genomics and proteomics approaches to the study of cancer-stroma interactions. BMC MEDICAL GENOMICS, v. 3, . (04/14846-0, 06/60162-0, 04/12054-9)
KOOLEN, HECTOR H. F.; GOMES, ALEXANDRE F.; SCHWAB, NICOLAS V.; EBERLIN, MARCOS N.; GOZZO, FABIO C.. Imidate-Based Cross-Linkers for Structural Proteomics: Increased Charge of Protein and Peptide Ions and CID and ECD Fragmentation Studies. JOURNAL OF THE AMERICAN SOCIETY FOR MASS SPECTROMETRY, v. 25, n. 7, p. 1181-1191, . (08/57805-2, 04/14846-0)
ARRUDA SANTOS, LUIZ FERNANDO; EBERLIN, MARCOS NOGUEIRA; GOZZO, FABIO CESAR. IRMPD and ECD fragmentation of intermolecular cross-linked peptides. Journal of Mass Spectrometry, v. 46, n. 3, p. 262-268, . (04/14846-0, 08/57805-2)