Análise da diversidade genômica de isolados geográficos do nucleopoliedrovírus de Anticarsia gemmatalis (AgMNPV)

Resumo

Os baculovírus possuem muitas características biológicas únicas entre os vírus de DNA: (i) dois fenótipos virais (Budded virus e Occlusion-Derived Virus) com distintas dinâmicas de infecção e diferentes morfologias de vírions; (ii) forma viral oclusa em matriz protéica (poliedro); (iii) genoma codificando mais de 100 ORFs. Estes entre outros aspectos morfológicos e moleculares fazem deles um modelo de estudo que desperta muito interesse, gerando importantes descobertas que repercutem em diversas áreas da ciência básica, como a virologia e a biologia molecular. Sob o ponto de vista aplicado, os estudos da família Baculoviridae têm gerado importantes resultados para as áreas de biotecnologia (expressão de proteínas heterólogas) e saúde (terapia gênica). No entanto, no Brasil, é na esfera de atividade agrícola que os baculovírus têm se mostrado eficientes agentes de controle biológico de pragas da agricultura. O baculovírus Anticarsia gemmatalis Multiple Nucleopolyhedrovirus (AgMNPV) tem sido utilizado desde a década de 80 como bioinseticida para controle de populações de lagarta-da-soja (A. gemmatalis) em cultivos de soja. Em 2006, foi sequenciado em nosso laboratório o genoma do protótipo AgMNPV-2D, o genótipo viral prototípico da espécie, empregado como bioinseticida viral. Este projeto de análise da diversidade genômica tem como objetivos principais: (i) identificar polimorfismos em seqüências codificantes e reguladoras da expressão gênica; (ii) avaliar as diferenças de organização e composição gênica na metapopulação de AgMNPV; (iii) identificar possíveis mecanismos de variação genômica entre os isolados selvagens; (iv) buscar por novos genes. Com este intuito, 17 populações virais de AgMNPV de diferentes épocas e regiões geográficas terão seus genomas seqüenciados por meio da tecnologia next-generation de seqüenciamento de DNA (pirosequenciamento).