| Processo: | 12/00543-1 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 01 de setembro de 2012 |
| Data de Término da vigência: | 30 de abril de 2015 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular |
| Pesquisador responsável: | Guilherme Menegon Arantes |
| Beneficiário: | Raphael Santa Rosa Sayegh |
| Instituição Sede: | Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil |
| Assunto(s): | Simulação de dinâmica molecular Simulação por computador Ressonância magnética nuclear |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Desenho de inibidores | Dinâmica Molecular | Ensembles conformacionais | Ressonância Magnética Nuclear | Simulação Computacional | Biofísica computacional |
Resumo As fosfatases Cdc25s participam de pontos de checagem do ciclo celular. Em diversos tipos de tumores ocorre a superexpressão dessas enzimas, podendo levar a uma desregulação do ciclo. Portanto, o estudo de inibidores das Cdc25s pode contribuir para o desenvolvimento de novas terapias anticâncer. Já foram descritos diversos inibidores pouco específicos da Cdc25B, isoforma cujo domínio catalítico teve sua estrutura cristalina determinada por difração de raios-X. Dados computacionais apontam para uma grande flexibilidade na região C-terminal que pode influenciar na ligação de inibidores competitivos. Neste projeto, planeja-se validar e estender estas simulações usando dados estruturais e dinâmicos de ressonância magnética nuclear da proteína. Estes dados serão usadosna construção de novos ensembles conformacionais. Os ensembles serão usados em experimentos computacionais de ancoragem com inibidores e os resultados comparados a dados experimentais dos mesmos complexos Cdc25B+inibidor. Assim, pretende-se verificar a influência da flexibilidade da proteína em solução no reconhecimento molecular. Este projeto pode trazer avanços importantes nas técnicas utilizadas no desenvolvimento de novos ligantes para proteínas flexíveis ou parcialmente desenoveladas. | |
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