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Análise dos mecanismos regulatórios transcricionais mediados por microRNAs na síndrome metabólica

Processo: 14/24162-2
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Data de Início da vigência: 01 de maio de 2016
Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2019
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Helder Takashi Imoto Nakaya
Beneficiário:Thiago Dominguez Crespo Hirata
Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCF). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:13/08216-2 - CPDI - Centro de Pesquisa em Doenças Inflamatórias, AP.CEPID
Bolsa(s) vinculada(s):17/17345-1 - Imunometabolismo de doenças inflamatórias: comparação de assinaturas gênicas de artrite induzida por chikungunya e obesidade, BE.EP.DD
Assunto(s):Cardiologia   Síndrome metabólica   Biologia de sistemas   Expressão gênica   MicroRNAs
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:biologia de sistemas | MicroRNAs | Síndrome Metabólica | cardiologia

Resumo

Síndrome Metabólica (SM) é um grupo de patologias (diabetes, dislipidemia, hipertrigliceridemia, hipertensão e obesidade) associado ao aumento de risco de mortalidade, ocorrência de eventos cardiovasculares e altos custos médicos. Os microRNAs (miRNAs) são RNAs pequenos não codificadores com ampla atividade na regulação gênica. Os miRNAs estão envolvidos na fisiopatologia de várias doenças metabólicas e, portanto, podem servir como potenciais biomarcadores. O objetivo desta pesquisa é utilizar a biologia de sistemas para estudar os papéis regulatórios dos miRNAs na SM. Dados públicos de perfis de expressão gênica gerados por microarray serão utilizados na construção de redes e módulos gênicos associados consistentemente com a SM. Estes serão integrados com dados de interação entre proteínas e alvos de miRNAs para identificação de miRNAs que influenciam vias moleculares da SM. Os resultados das análises computacionais serão comparados com dados de perfis de expressão de miRNAs de pacientes com diagnóstico de SM. Estes dados serão gerados pela tecnologia de sequenciamento de alto desempenho (miRNA-seq) e sua validação técnica será realizada por qPCR. Além disso, a validação funcional dos miRNAs será realizada utilizando linhagens de células co-transfectadas com o miRNA e um vetor repórter contendo o gene alvo. Assim, a identificação de miRNAs e redes gênicas associados à diferentes patologias metabólitas poderão aumentar nosso entendimento sobre os complexos mecanismos moleculares e fisiopatológicos da síndrome metabólica. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
SCHRODER, WAYNE A.; HIRATA, THIAGO D.; LE, THUY T.; GARDNER, JOY; BOYLE, GLEN M.; ELLIS, JONATHAN; NAKAYAMA, ERI; PATHIRANA, DILAN; NAKAYA, HELDER I.; SUHRBIER, ANDREAS. SerpinB2 inhibits migration and promotes a resolution phase signature in large peritoneal macrophages. SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, . (17/17345-1, 14/24162-2)
RUSSO, PEDRO S. T.; FERREIRA, GUSTAVO R.; CARDOZO, LUCAS E.; BUERGER, MATHEUS C.; ARIAS-CARRASCO, RAUL; MARUYAMA, SANDRA R.; HIRATA, THIAGO D. C.; LIMA, DIOGENES S.; PASSOS, FERNANDO M.; FUKUTANI, KIYOSHI F.; et al. CEMiTool: a Bioconductor package for performing comprehensive modular co-expression analyses. BMC Bioinformatics, v. 19, . (15/25825-8, 13/08216-2, 12/19278-6, 14/19323-7, 14/24162-2, 17/05762-7, 15/20897-0)
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
HIRATA, Thiago Dominguez Crespo. Análise dos mecanismos regulatórios transcricionais mediados por microRNAs na Síndrome Metabólica. 2019. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Conjunto das Químicas (IQ e FCF) (CQ/DBDCQ) São Paulo.