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Análise proteômica quantitativa de tecido neuronal obtido de pacientes e modelos animais de epilepsia

Processo: 16/19484-6
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2016
Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2020
Área de conhecimento:Ciências da Saúde - Medicina
Pesquisador responsável:Iscia Teresinha Lopes Cendes
Beneficiário:Barbara Henning Silva
Instituição Sede: Faculdade de Ciências Médicas (FCM). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:13/07559-3 - Instituto Brasileiro de Neurociência e Neurotecnologia - BRAINN, AP.CEPID
Bolsa(s) vinculada(s):19/12333-0 - Um método estatístico para detecção de variação no número de cópias usando dados de sequenciamento de nova geração, BE.EP.PD
Assunto(s):Epilepsia   Biologia computacional
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Analise Proteômica | bioinformática | Biologia Computacional | epilepsia | Neurosciencias

Resumo

A quantificação e comparação do perfil proteico entre organismos saudáveis e doentes pode revelar mecanismos moleculares potencialmente causadores de doenças. Técnicas de identificação e quantificação de proteínas em tecidos biológicos, como a espectrometria de massa, têm evoluído rapidamente e, consequentemente, tem sido produzidos conjuntos de dados cada vez maiores e mais complexos. O objetivo principal do projeto é desenvolver e aplicar ferramentas de análise proteômica em tecido de modelos animais e material cirúrgico obtido de pacientes com epilepsia. Especificamente pretendemos: i) realizar a análise da expressão proteica comparativa para identificar e anotar proteínas cuja expressão é alterada em indivíduos afetados, quando comparados a indivíduos saudáveis; ii) disponibilizar publicamente ferramentas desenvolvidas ao longo da execução do projeto, por meio de iniciativas abertas como o Projeto Biocondutor. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
CANTO, AMANDA M.; VIEIRA, ANDRE S.; MATOS, ALEXANDRE H. B.; CARVALHO, BENILTON S.; HENNING, BARBARA; NORWOOD, BRAXTON A.; BAUER, SEBASTIAN; ROSENOW, FELIX; GILIOLI, ROVILSON; CENDES, FERNANDO; et al. Laser microdissection-based microproteomics of the hippocampus of a rat epilepsy model reveals regional differences in protein abundances. SCIENTIFIC REPORTS, v. 10, n. 1, . (13/07559-3, 13/08635-5, 15/12960-4, 16/19484-6)
CANTO, AMANDA M.; MATOS, ALEXANDRE H. B.; GODOI, ALEXANDRE B.; VIEIRA, ANDRE S.; AOYAMA, BEATRIZ B.; ROCHA, CRISTIANE S.; HENNING, BARBARA; CARVALHO, BENILTON S.; PASCOAL, VINICIUS D. B.; VEIGA, DIOGO F. T.; et al. Multi-omics analysis suggests enhanced epileptogenesis in theCornu Ammonis3 of the pilocarpine model of mesial temporal lobe epilepsy. HIPPOCAMPUS, v. 31, n. 2, p. 122-139, . (16/19484-6, 19/04335-3, 13/08635-5, 13/07559-3, 19/00213-0, 15/12960-4)
CANTO, AMANDA M.; GODOI, ALEXANDRE B.; MATOS, ALEXANDRE H. B.; GERALDIS, JAQUELINE C.; ROGERIO, FABIO; ALVIM, MARINA K. M.; YASUDA, CLARISSA L.; GHIZONI, ENRICO; TEDESCHI, HELDER; VEIGA, DIOGO F. T.; et al. Benchmarking the proteomic profile of animal models of mesial temporal epilepsy. ANNALS OF CLINICAL AND TRANSLATIONAL NEUROLOGY, v. 9, n. 4, p. 14-pg., . (16/19484-6, 13/07559-3, 19/00213-0, 13/07467-1, 15/12960-4)