Estudo de associação genômica ampla de componentes principais de características de crescimento e escores visuais em bovinos da raça Nelore

Resumo

A análise de componentes principais (PCA) é uma técnica que permite explorar informações importantes a partir de um conjunto de dados multivariados o qual é posteriormente expresso como um novo conjunto de variáveis de mesma dimensão denominadas de componentes principais (PCs). Os componentes principais apresentam propriedades importantes que podem auxiliar na identificação de possíveis associações entre as características estudadas com interpretações biológicas importantes, normalmente não observadas no conjunto de dados original. Os estudos de associação genômica ampla (GWAS) surgem como importante ferramenta na identificação de possíveis regiões genômicas com efeitos significativos sobre estes componentes principais que possam apresentar alguma interpretação biológica. Objetiva-se com o presente estudo realizar análises de associação genômica ampla para identificar regiões genômicas associadas com os componentes principais de características de crescimento e escore visual em bovinos da raça Nelore. Posteriormente, análises de enriquecimento funcional serão conduzidas para caracterizar as regiões genômicas e os genes candidatos serão analisados para todas as categorias encontradas na anotação funcional: processos biológicos, funções moleculares e componentes celulares. Serão utilizados dados da base Aliança Nelore com informações de, aproximadamente, 600.000 animais ao nascimento, 500.000 ao desmame e 330.000 ao soberano, provenientes de 246 fazendas localizadas em diferentes regiões do Brasil e Paraguai. A análise de componentes principais será realizada pela reparametrização da equação de modelo misto multivariada. Os estudos de associação genômica ampla serão conduzidos considerando as metodologias weighted single step GBLUP (wssGBLUP) e Bayes C, utilizando como "fenótipo" os valores genéticos preditos para os componentes principais, fornecidos pela análise quantitativa. Espera-se que este trabalho contribua para o aprofundamento da investigação de regiões genômicas associadas aos componentes principais, auxiliando, assim, o processo de seleção da raça. (AU)