Desenvolvimento de uma ferramenta computacional para busca e predição de força de promotores em bactéria para aplicações em biologia sintética

Resumo

Os genes não são expressos a todo momento, eles precisam ser regulados e uma etapa desta regulação é o início da transcrição. As bactérias possuem uma maquinaria celular para regular e fazer a transcrição, maquinaria que a biologia sintética compara a verdadeiros programas de tomada de decisão. Os atores deste processo são a RNA polimerase, os fatores de transcrição (que ativam ou inibem a transcrição), sequências no próprio DNA, os chamados promotores, que estão relacionados com a frequência da atividade de transcricional, e os fatores sigma, que reconhecem essas sequências promotoras no DNA. O presente projeto visa o desenvolvimento de uma ferramenta que integre diversos parâmetros para busca e predição de força de promotores bacterianos. A especificidade de um promotor oferece ajuste fino da transcrição e este, por sua vez, pode ser usado em inúmeras aplicações. Várias abordagens já foram descritas na literatura, tanto experimentais como computacionais. A abordagem deste projeto será reunir em uma plataforma computacional as características sobre sequências promotoras bacterianas de trabalhos anteriores e usá-las em um modelo para predição e validá-lo experimentalmente com promotores sintéticos. (AU)