Investigação da Taxa de Pseudogenização entre genomas do Complexo Mycobacterium tuberculosis

Resumo

A tuberculose é uma doença infectocontagiosa causada por bactérias do complexo Mycobacterium tuberculosis (MTBC) capaz de afetar humanos e animais. Membros do MTBC são descrito a partir de processos evolutivos clonais e apresentam grande similaridade genômica (> 99,9%). Porém, mesmo devido a essa alta similaridade, essas espécies apresentam variações fenotípicas relacionadas à virulência e ao tropismo por hospedeiros, sendo algumas adaptadas a humanos (i.e. especialistas), outras capazes de infectar diversos animais (i.e. generalistas). A pseudogenização é descrita como forma de variação gênica em espécies de evolução clonal, principalmente em Mycobacterium tuberculosis (tuberculose humana), e tem sido associada ao processo de especialização bacteriana em relação ao hospedeiro dessa espécie. No entanto, a descrição de processos de decay genômico e pseudogenização ainda não foram detalhadamente descritos nos demais membros do MTBC, e o impacto dessa remodelagem genômica em espécies generalistas do complexo, como por exemplo Mycobacterium bovis, ainda é desconhecido. Objetivo: Analisar taxas de pseudogenização e caracterizar os pseudogenes em diferentes espécies do MTBC e Mycobacterium canettii, para, então, correlacionar com os devidos fenótipos desses micro-organismos. Material e métodos: Genomas das espécies do MTBC e M. canetti disponíveis no GenBank serão selecionadas para identificação e caracterização de pseudogenes. Após confirmação, as taxas de pseudogenes serão relacionadas com os fenótipos das micobactérias estudadas. Resultados esperados: A avaliação da extensão do impacto da remodelagem genômica na expressão fenotípica desses agentes pode ter implicações significativas no desenvolvimento de vacinas para prevenir a tuberculose em humanos e animais.