Comparação de potenciais não-específicos com potenciais baseados em estrutura no estudo de enovelamento de proteínas

Resumo

Frente ao desafio de compreender o processo de enovelamento de proteínas através de simulações computacionais, surgiram modelos físicos minimalistas baseados em diferentes premissas e observações experimentais. Um modelo que apresenta eficiência e baixo custo computacional é o modelo baseado em estrutura, no qual seu potencial é obtido através da estrutura nativa de uma proteína. Devido às suas correlações diretas com dados experimentais, esse modelo foi amplamente testado e utilizado pela comunidade científica, de forma a ser referência quanto aos modelos computacionais simplificados. Contudo, há também modelos que utilizam regularidades estatísticas de bioinformática, como é o caso do AWSEM (Associative memory, Water-mediated, Structure and Energy Model), que têm como diferencial a capacidade de predizer a estrutura de uma proteína a partir de sua sequência. O objetivo principal desse projeto é realizar simulações utilizando ambos os modelos, de forma a comparar seus resultados com os dados experimentais, e explorar seus aspectos complementares. (AU)