Evolução experimental em quase-espécies com coronavírus aviário

Resumo

Quase-espécies é um termo utilizado para descrever a genética de populações colaborativa de múltiplas variantes subconsensuais sob uma sequência dominante de vírus RNA e alguns vírus DNA. Cada variante no espectro pode mostrar diferentes fitness, o qual muda de acordo com pressões de seleção como imunológicas ou por salto interespécies de hospedeiros. Para Coronavírus aviário (AvCoV), os efeitos de salto interespécies de hospedeiros foram estudados avaliado até o momento ou com baixa cobertura de sequencias ou após um baixo número de passagens em cultivo celular. Além disso, o efeito da diversidade da imunidade humoral sobre este fenômeno ainda não foi estudado. Cobrindo estes aspectos, este projeto tem três objetivos: medir os efeitos de soros hiperimunes de galinhas contra diferentes vacinas de AvCoV sobre o fitness de uma amostra fixa do vírus em cultivo celular utilizando qPCR, estudar a constituição de quase-espécies desta mesma amostra de AvCoV após a incubação com estes soros e utilizado sequenciamento profundo e seguir a evolução em quase-espécies de uma amostra fixa de AvCoV. Para este fim, a amostra Beaudette de AvCoV será serialmente passada em células VERO até a 15ª passagem e as variantes serão estudadas nos genomas completos com sequenciamento profundo e qPCR. Em outro experimento, a amostra Beaudette será incubada com soro de galinhas vacinadas com amostras homólogas e heterólogas de AvCoV e analisada do mesmo modo. Espera-se que este projeto gere indicadores para quase-especies de coronavirus tanto em termos de flutuações de frequências de cada variante sob uma diversidade de pressões de seleção imunológica bem como entendimentos sobre as consequências da vacinação em doenças causadas por coronavirus. (AU)