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Busca e caracterização de inibidores da enzima papain-like protease (PL-Pro) de SarS-Cov-2

Processo: 22/15854-4
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Data de Início da vigência: 01 de março de 2023
Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2025
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Pesquisador responsável:Maria Cristina Nonato
Beneficiário:Diogo Fernandes Boerin
Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Assunto(s):COVID-19   Cristalografia   Enzimas   Inibidores   Peptídeo hidrolases   SARS-CoV-2   Cristalografia de proteínas
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Covid-19 | Cristalografia | Enzima | Inibidores | PLPro | Protease | SARS-CoV-2 | Cristalografia de Proteínas

Resumo

Mesmo após quase três anos desde o primeiro caso de COVID-19, do desenvolvimento de vacinas, e até da identificação de alguns fármacos que auxiliam na redução da severidade da doença, a COVID-19 ainda representa um sério problema de saúde pública no mundo. A busca por formas eficazes de combater os sintomas da doença é ainda necessária e urgente. Nesse projeto, pretendemos contribuir na busca de inibidores para a enzima PLPro de SarS-CoV-2, vírus responsável pela COVID-19. Esse é um projeto desenvolvido pelo nosso laboratório em colaboração com pesquisadores nacionais e internacionais e com apoio financeiro na modalidade BRICS-CNPQ. Através do uso de técnicas in sílico, vários inibidores foram propostos pelo grupo da Professora Carolina Horta Andrade da Faculdade de Farmácia da Universidade Federal de Goiás (UFG) e sintetizados pelo grupo parceiro da África do Sul, a H3D, da Universidade da Cidade do Cabo, coordenado pelo Professor Kelly Chibale. Nosso projeto consiste em explorar a técnica de triagem por Fluorimetria Diferencial (DSF) para a identificação de ligantes da proteína PLPro e a técnica de difração de raios-X para a caracterização das bases moleculares de interação dos ligantes identificados com a proteína alvo. Os resultados obtidos através de nossos estudos, serão utilizados pela equipe para o planejamento e síntese de inibidores mais potentes e seletivos para a PLPro, assim como com propriedades farmacocinéticas, farmacodinâmicas e toxicológicas otimizadas. Esse projeto visa introduzir ao aluno na área de biologia estrutural aplicada a química medicinal.

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
SOUSA, BRUNA K. P.; MOTTIN, MELINA; SEANEGO, DONALD; JURISCH, CHRISTOPHER D.; RODRIGUES, BEATRIZ S. A.; DA SILVA, VERONICA L. S.; ANDRADE, MILENE APARECIDA; MORAIS JR, GILBERTO S.; BOERIN, DIOGO F.; FROES, THAMIRES Q.; et al. Discovery of Non-Covalent Inhibitors for SARS-CoV-2 PLpro: Integrating Virtual Screening, Synthesis, and Experimental Validation. ACS Medicinal Chemistry Letters, v. N/A, p. 10-pg., . (21/13237-5, 20/06190-0, 22/15854-4, 20/05369-6, 21/10084-3)