Laboratório de sequenciamento no Programa Genoma Humano do Câncer

Resumo

Nosso laboratório (PM 1) foi um dos 5 laboratórios de sequenciamento selecionados para fazer parte do grupo da Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo (grupo PM) no projeto Genoma-Câncer FAPESP-Instituto Ludwig, sob a coordenação do Dr. Marcelo Briones. Durante o primeiro ano do projeto concentramo-nos no desenvolvimento e ação das técnicas de clonagem e sequenciamento; durante o segundo e terceiro, dedicamo-nos à produção das sequências propriamente ditas, atingindo o total 2.209 (conforme especificado no Anexo 1). Este total supera a meta estipulada pelo contrato inicial de 25.000 sequências. Durante a fase final do projeto tivemos algumas dificuldades, pois o material encaminhado para clonagem não apresentava a mesma qualidade das amostras anteriores. Anexamos, também, exemplos de placas submetidas e que foram abortadas pelo programa em decorrência de sequências com qualidade inadequada. Apesar das inúmeras tentativas de melhorar a qualidade das sequências, não fomos bem sucedidos. O projeto resultou em duas publicações em revista de circulação internacional, com co-autoria dos membros do laboratório e que estão incluídas neste relatório. Além disso, o Laboratório de Endocrinologia Molecular, por meio do conhecimento adquirido no desenvolvimento deste projeto e da infraestrutura recebida, está desenvolvendo diversos outros projetos de pesquisa na área de endocrinologia molecular, alguns deles já concluídos e aguardando publicação e outros submetidos a revistas de circulação internacional. (AU)