Genetic diversity, virulence genotype and antimicrobial resistance of uropathogenic Escherichia coli (UPEC) isolated from sows

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Spindola, Maria G. ^[1] ; Cunha, Marcos P. V. ^[1] ; Moreno, Luisa Z. ^[1] ; Amigo, Cristina R. ^[1] ; Silva, Ana P. S. ^[1] ; Parra, Beatriz M. ^[1] ; Poor, Andre P. ^[1] ; de Oliveira, Carolina H. ^[1] ; Perez, Barbara P. ^[1] ; Knobl, Terezinha ^[1] ; Moreno, Andrea M. ^[1]

Afiliação do(s) autor(es)

^[1] Univ Sao Paulo, Fac Med Vet & Zootecnia, Sao Paulo - Brazil

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: VETERINARY QUARTERLY; v. 38, n. 1, p. 79-87, OCT 26 2018.
• Citações Web of Science: 0

Resumo

Background: Urinary tract infections (UTI) cause severe losses to the swine industry worldwide and uropathogenic Escherichia coli (UPEC) are the main agent isolated from UTI in sows.Objective: The aim of this study was to investigate the virulence genes, assess the phylogenetic background, clonal diversity, and the pattern of resistance to antimicrobials in 186 isolates of UPEC isolated from sows in Brazil.Materials and methods: Urine samples from 300 sows of three herds with clinical signs from SAo Paulo State (Brazil) were screened for UTI; samples with suggestive results were submitted to bacterial isolation. E. coli strains isolated were characterized using disk diffusion technique, polymerase chain reaction and Single-enzyme amplification fragment length polymorphism (SE-AFLP).Results: Virulence genes focH and papC were present in 78.5% and 58% of strains, respectively, followed by cnf1 (23.2%), afa (13.4%), sfa (11.3%), iucD (6.9%), and hlyA (1.6%). No clonal relatedness was found by SE-AFLP. A total of 98% of isolates (182/186) were multidrug resistant, and the highest levels of resistance were to sulfonamides, tetracycline, florfenicol, and ampicillin. Isolates were classified in phylogenetic group B1 (34.4%), followed by D (33.9%), E (30.1%) and A (1.6%).Conclusions: The data obtained suggest that pigs from clinically affected herds may serve as a reservoir of uropathogenic and multidrug-resistant E. coli strains. (AU)

• Processo FAPESP: 13/17136-2 - Caracterização de estirpes de Leptospira isoladas no Brasil através de tipificação por eletroforese em campo pulsado (PFGE) e análise comparativa de genomas.
• Beneficiário: Luisa Zanolli Moreno
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Processo FAPESP: 13/16946-0 - Caracterização fenotípica e genotípica de cepas de Salmonella entérica isoladas de carne suína no município de São Paulo.
• Beneficiário: Vasco Túlio de Moura Gomes
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Processo FAPESP: 14/11523-7 - Pesquisa e caracterização de genes plasmidiais de resistência às quinolonas em escherichia coli isoladas da cadeia de produção de aves e suínos
• Beneficiário: Marcos Paulo Vieira Cunha
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Processo FAPESP: 16/25745-7 - Avaliação da virulência e caracterização fenotípica e genômica de estirpes de Corynebacterium spp. isoladas de infecção urinária de suínos
• Beneficiário: Luisa Zanolli Moreno
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 17/09515-4 - Identificação e caracterização fenotípica de patógenos bacterianos causadores de metrite em fêmeas suínas.
• Beneficiário: André Pegoraro Poor
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Processo FAPESP: 11/22608-5 - Infecções de trato urinário causada por Escherichia coli uropatogênica em fêmeas suínas no estado de São Paulo
• Beneficiário: Maria Garcia Spindola
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica