Discovery of novel astrovirus and calicivirus identified in ruddy turnstones in Brazil

Autor(es)

de Souza, William Marciel ^{[1, 2, 3]} ; Fumagalli, Marcilio Jorge ^[1] ; de Araujo, Jansen ^[4] ; Ometto, Tatiana ^[4] ; Modha, Sejal ^[2] ; Thomazelli, Luciano Matsumiya ^[4] ; Durigon, Edison Luis ^[4] ; Murcia, Pablo Ramiro ^[2] ; Moraes Figueiredo, Luiz Tadeu ^[1]

Afiliação do(s) autor(es)

^[1] Univ Sao Paulo, Virol Res Ctr, Sch Med Ribeirao Preto, BR-14049900 Ribeirao Preto, SP - Brazil

^[2] Univ Glasgow, MRC, Ctr Virus Res, Glasgow G61 1QH, Lanark - Scotland

^[3] Univ Estadual Campinas, Inst Biol, Dept Genet Evolut & Bioagents, BR-13083862 Campinas, SP - Brazil

^[4] Univ Sao Paulo, Inst Biomed Sci, BR-05508900 Sao Paulo, SP - Brazil

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: SCIENTIFIC REPORTS; v. 9, APR 3 2019.
• Citações Web of Science: 0

Resumo

Birds are the natural reservoir of viruses with zoonotic potential, as well as contributing to the evolution, emergence, and dissemination of novel viruses. In this study, we applied a high-throughput screening approach to identify the diversity of viruses in 118 samples of birds captured between October 2006 to October 2010 in the North and Northeast regions of Brazil. We found nearly complete genomes of novel species of astrovirus and calicivirus in cloacal swabs of ruddy turnstones (Arenaria interpres) collected in Coroa do Aviao islet, Pernambuco State. These viruses are positive-sense single-stranded RNA with a genome of -7 to 8 kb, and were designated as Ruddy turnstone astrovirus (RtAstV) and Ruddy turnstone calicivirus (RTCV), respectively. Phylogenetic analysis showed that RtAstV and RTCV grouped in a monophyletic clade with viruses identified from poultry samples (i.e., chicken, goose, and turkey), including viruses associated with acute nephritis in chickens. Attempts of viral propagation in monkey and chicken cell lines for both viruses were unsuccessful. Also, we found genomes related with viral families that infect invertebrates and plants, suggesting that they might be ingested in the birds' diet. In sum, these findings shed new light on the diversity of viruses in migratory birds with the notable characterization of a novel astrovirus and calicivirus. (AU)

• Processo FAPESP: 12/24150-9 - Pesquisa de vírus em roedores silvestres, mosquitos e carrapatos
• Beneficiário: William Marciel de Souza
• Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Processo FAPESP: 17/13981-0 - Caracterização, genômica e diagnóstico de vírus com importância em saúde pública no Brasil por sequenciamento de alto desempenho
• Beneficiário: William Marciel de Souza
• Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 16/01414-1 - Produção de peptídeos recombinantes virais antigênicos e desenvolvimento de métodos sorológicos para diagnóstico de infecções pelos Vírus Chikungunya, Mayaro e Zika
• Beneficiário: Marcilio Jorge Fumagalli
• Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Processo FAPESP: 13/05485-2 - Estudo do vírus da Doença de Newcastle pelo método de RT-PCR em tempo real, em aves silvestres de diferentes regiões do Brasil e da Antártica
• Beneficiário: Luciano Matsumiya Thomazelli
• Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Processo FAPESP: 13/14929-1 - Detecção de arbovírus e outros vírus de RNA por RT-PCR em tempo real e estudo do viroma
• Beneficiário: Luiz Tadeu Moraes Figueiredo
• Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Processo FAPESP: 11/13821-7 - Eco-epidemiologia comparada do vírus da Influenza Aviária em aves migratórias no território brasileiro
• Beneficiário: Jansen de Araujo
• Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 18/09383-3 - Estudo sobre epitopos de Flavivirus com importância médica no Brasil e de seus anticorpos
• Beneficiário: Marcilio Jorge Fumagalli
• Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Processo FAPESP: 09/05994-9 - Monitoramento do Vírus do Oeste do Nilo no Brasil
• Beneficiário: Tatiana Ometto de Araujo
• Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Processo FAPESP: 15/05778-5 - Análises de bioinformática de dados de metagenômica viral de animais do Brasil e Antártida
• Beneficiário: William Marciel de Souza
• Linha de fomento: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado