Binding studies of a putative C. pseudotuberculosis target protein from Vitamin B-12 Metabolism

Autor(es)

Peinado, Rafaela dos S. ^[1] ; Olivier, Danilo S. ^[1] ; Eberle, Raphael J. ^[1] ; de Moraes, Fabio R. ^[1] ; Amaral, Marcos S. ^[2] ; Arni, Raghuvir K. ^[1] ; Coronado, Monika A. ^[1]

Afiliação do(s) autor(es)

^[1] Univ Estadual Paulista UNESP, Multiuser Ctr Biomol Innovat, Dept Phys, Inst Biociencias Letras & Ciencias Exatas Ibilce, BR-15054000 Sao Jose Do Rio Preto, SP - Brazil

^[2] Univ Fed Mato Grosso do Sul, Inst Phys, BR-79090700 Campo Grande, MS - Brazil

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: SCIENTIFIC REPORTS; v. 9, APR 23 2019.
• Citações Web of Science: 0

Resumo

Vitamin B-12 acts as a cofactor for various metabolic reactions important in living organisms. The Vitamin B-12 biosynthesis is restricted to prokaryotes, which means, all eukaryotic organisms must acquire this molecule through diet. This study presents the investigation of Vitamin B-12 metabolism and the characterization of precorrin-4 C(11)-methyltransferase (CobM), an enzyme involved in the biosynthesis of Vitamin B-12 in Corynebacterium pseudotuberculosis. The analysis of the C. pseudotuberculosis genome identified two Vitamin B-12-dependent pathways, which can be strongly affected by a disrupted vitamin metabolism. Molecular dynamics, circular dichroism, and NMR-STD experiments identified regions in CobM that undergo conformational changes after s-adenosyl-L-methionine binding to promote the interaction of precorrin-4, a Vitamin B(12 )precursor. The binding of s-adenosyl-L-methionine was examined along with the competitive binding of adenine, dATP, and suramin. Based on fluorescence spectroscopy experiments the dissociation constant for the four ligands and the target protein could be determined; SAM (1.4 +/- 0.7 mu M), adenine (17.8 +/- 1.5 mu M), dATP (15.8 +/- 2.0 mu M), and Suramin (6.3 +/- 1.1 mu M). The results provide rich information for future investigations of potential drug targets within the C. pseudotuberculosis's Vitamin B12 metabolism and related pathways to reduce the pathogen's virulence in its hosts. (AU)

• Processo FAPESP: 09/53989-4 - EMU: aquisição de espectrômetro de ressonância magnética nuclear para estudos de biomoléculas
• Beneficiário: Raghuvir Krishnaswamy Arni
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários
• Processo FAPESP: 15/18868-2 - Aquisição de equipamento multiusuário para biologia molecular e estrutural
• Beneficiário: Raghuvir Krishnaswamy Arni
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários
• Processo FAPESP: 16/08104-8 - Aspectos funcionais e estruturais de duas proteínas de ligação de DNA codificadas pela Corynebacterium pseudotuberculosis
• Beneficiário: Raphael Josef Eberle
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 15/13765-0 - ESTUDOS ESTRUTURAIS E CARACTERIZAÇÃO DE PROTEÍNAS POR CRISTALOGRAFIA DE RAIOS-X E RESSONÂNCIA MAGNETICA NUCLEAR. Investigações estruturais e biofísicas dos mecanismos moleculares de proteínas funcionais
• Beneficiário: Raghuvir Krishnaswamy Arni
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Processo FAPESP: 16/12904-0 - Mecanismos e Interações Moleculares de Moléculas Bioativas com a Protease NS3 do Zika Vírus.
• Beneficiário: Monika Aparecida Coronado
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado