Identification of novel mRNA isoforms associated with meat tenderness using RNA sequencing data in beef cattle

Autor(es)

Magalhaes Muniz, Maria Malane ^{[1, 2]} ; Simielli Fonseca, Larissa Fernanda ^[1] ; dos Santos Silva, Danielly Beraldo ^[1] ; de Oliveira, Hinayah Rojas ^[2] ; Baldi, Fernando ^{[3, 1]} ; Chardulo, Artur Loyola ^{[3, 4]} ; Ferro, Jesus Aparecido ^{[3, 1]} ; Canovas, Angela ^[2] ; de Albuquerque, Lucia Galvao ^{[3, 1]}

Afiliação do(s) autor(es)

^[1] Sao Paulo State Univ Unesp, Sch Agr & Vet Sci, Jaboticabal, SP - Brazil

^[2] Univ Guelph, Ctr Genet Improvement Livestock, Dept Anim Biosci, Guelph, ON - Canada

^[3] Natl Council Sci & Technol Dev CNPq, Brasilia, DF - Brazil

^[4] Sao Paulo State Univ Unesp, Coll Vet & Anim Sci, Botucatu, SP - Brazil

• Tipo de documento: Artigo de Revisão
• Fonte: MEAT SCIENCE; v. 173, MAR 2021.
• Citações Web of Science: 0

Resumo

The Warner-Bratzler shear force (WBSF) and myofibrillar fragmentation index (MFI) are complementary methodologies used to measure beef tenderness. Longissimus thoracis samples from the 20 most extreme bulls (out of 80 bulls set) for WBSF (tender (n = 10) and tough (n = 10)) and MFI (high (n = 10) and low (n = 10)) traits were collected to perform transcriptomic analysis using RNA-Sequencing. All analysis were performed through CLC Genomics Workbench. A total of 39 and 27 transcripts for WBSF and MFI phenotypes were DE, respectively. The possible DE novel mRNA isoforms, for WBSF and MFI traits, are myosin encoders (e.g. MYL1 and MYL6). In addition, we identified potential mRNA isoforms related to genes affecting the speed fibers degradation during the meat aging process. The DE novel transcripts are transcripted by genes with biological functions related to oxidative process, energy production and striated muscle contraction. The results suggest that the identified mRNA isoforms could be used as potential candidate to select animals in order to improve meat tenderness. (AU)

• Processo FAPESP: 18/20026-8 - EMU concedido no processo 2017/10630-2: servidor
• Beneficiário: Lucia Galvão de Albuquerque
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários
• Processo FAPESP: 11/21241-0 - Estudo da variabilidade genética do perfil de ácidos graxos da carne de bovinos da raça Nelore terminados em confinamento
• Beneficiário: Fernando Sebastián Baldi Rey
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
• Processo FAPESP: 18/11154-2 - Identificação de genes de co-expressão em tecido muscular de bovinos Nelore divergente para fenótipos de marmoreio e índice de fragmentação miofibrilar, usando dados de RNA-Seq
• Beneficiário: Maria Malane Magalhães Muniz
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Processo FAPESP: 09/16118-5 - Ferramentas genômicas no melhoramento genético de características de importância econômica direta em bovinos da raça Nelore
• Beneficiário: Lucia Galvão de Albuquerque
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Processo FAPESP: 17/10630-2 - Aspectos genéticos da qualidade, eficiência e sustentabilidade da produção de carne em animais da raça Nelore
• Beneficiário: Lucia Galvão de Albuquerque
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático