Dataset of dual RNA-seq mapping in visceral leishmaniasis: Inquiry on parasite transcripts in human blood transcriptome upon Leishmania infantum infection

Autor(es)

Gomes, Ellen ; Rogerio, Luana Aparecida ; Takamiya, Nayore Tamie ; Torres, Caroline ; da Silva, Joao Santana ; Almeida, Roque Pacheco ; Maruyama, Sandra Regina

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: DATA IN BRIEF; v. 46, p. 7-pg., 2022-12-17.

Resumo

This dataset is related to the article "Insight Into the Long Noncoding RNA and mRNA Coexpression Profile in the Hu-man Blood Transcriptome Upon Leishmania infantum Infec-tion " by S.R. Maruyama, C.A. Fuzo, A .E.R. Oliveira, L.A . Roge-rio, N.T. Takamiya, G. Pessenda, E.V. de Melo, A.M. da Silva, A.R. Jesus, V. Carregaro, H.I. Nakaya, R.P. Almeida and J.S. da Silva. Frontiers in Immunology, 2022. Through the reuse of raw sequencing data, we generated original dataset by per-forming a dual RNA-seq mapping procedure to survey the parasite transcripts found in RNA-seq samples from blood of visceral leishmaniasis patients. Diseased patients with active infection displayed the highest number of reads mapped to L. infantum genome. Even after six months later of the treatment, when the patients were considered cured, parasite reads were still detected. Parasite reads were also detected in asymptomatic individuals. The original dual RNA-seq alignment read count data provided here can be further explored to evaluate either host or parasite transcripts. (C) 2022 The Author(s). Published by Elsevier Inc. (AU)

• Processo FAPESP: 16/20258-0 - Leishmaniose visceral: abordagens genômicas para análise molecular integrada do hospedeiro e do parasito
• Beneficiário: Sandra Regina Costa Maruyama
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
• Processo FAPESP: 17/16328-6 - Leishmaniose Visceral: abordagens genômicas para análise molecular integrada do hospedeiro e do parasito.
• Beneficiário: Sandra Regina Costa Maruyama
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Jovens Pesquisadores
• Processo FAPESP: 21/12464-8 - Desenvolvimento de ferramentas moleculares para o estudo de parasitas emergentes em Leishmaniose Visceral
• Beneficiário: Nayore Tamie Takamiya
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Processo FAPESP: 22/01525-9 - Ferramentas e técnicas para manipulação de ácidos nucleicos em amostras de leishmaniose visceral.
• Beneficiário: Ellen Gomes Alves
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Processo FAPESP: 20/14011-8 - Caracterização fenotípica e análise genômica de parasitos Crithidia-like obtidos de pacientes diagnosticados com Leishmaniose Visceral
• Beneficiário: Luana Aparecida Rogerio
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Processo FAPESP: 13/08216-2 - CPDI - Centro de Pesquisa em Doenças Inflamatórias
• Beneficiário: Fernando de Queiroz Cunha
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão - CEPIDs
• Processo FAPESP: 21/10358-6 - Análise genômica de parasitos da subfamília Leishmaniinae isolados de casos de Leishmaniose visceral humana
• Beneficiário: Caroline Torres
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica