Leishmaniinae: Evolutionary inferences based on protein expression profiles (PhyloQuant) congruent with phylogenetic relationships among Leishmania, Endotrypanum, Porcisia, Zelonia, Crithidia, and Leptomonas

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Mule, Simon Ngao ; Aleman, Evaristo Villalba ; Rosa-Fernandes, Livia ; Saad, Joyce S. ; de Oliveira, Gilberto Santos ; Martins, Deivid ; Angeli, Claudia Blanes ; Brandt-Almeida, Deborah ; Cortez, Mauro ; Larsen, Martin Rossel ; Shaw, Jeffrey J. ; Teixeira, Marta M. G. ; Palmisano, Giuseppe

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: PROTEOMICS; v. 24, n. 18, p. 17-pg., 2024-06-08.

Resumo

Evolutionary relationships among parasites of the subfamily Leishmaniinae, which comprises pathogen agents of leishmaniasis, were inferred based on differential protein expression profiles from mass spectrometry-based quantitative data using the PhyloQuant method. Evolutionary distances following identification and quantification of protein and peptide abundances using Proteome Discoverer and MaxQuant software were estimated for 11 species from six Leishmaniinae genera. Results clustered all dixenous species of the genus Leishmania, subgenera L. (Leishmania), L. (Viannia), and L. (Mundinia), sister to the dixenous species of genera Endotrypanum and Porcisia. Placed basal to the assemblage formed by all these parasites were the species of genera Zelonia, Crithidia, and Leptomonas, so far described as monoxenous of insects although eventually reported from humans. Inferences based on protein expression profiles were congruent with currently established phylogeny using DNA sequences. Our results reinforce PhyloQuant as a valuable approach to infer evolutionary relationships within Leishmaniinae, which is comprised of very tightly related trypanosomatids that are just beginning to be phylogenetically unraveled. In addition to evolutionary history, mapping of species-specific protein expression is paramount to understand differences in infection processes, tissue tropisms, potential to jump from insects to vertebrates including humans, and targets for species-specific diagnostic and drug development. (AU)

• Processo FAPESP: 21/14751-4 - Novas metodologias analíticas baseadas em espectrometria de massas para o estudo de modificações pós-traducionais de proteínas
• Beneficiário: Simon Ngao Mule
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 16/23689-2 - Identificação da variabilidade proteômica e suas modificações nas Leishmanias L. (V.) braziliensis, L. (L.) amazonensis e L. (L.) chagasi, utilizando uma abordagem shotgun protemics.
• Beneficiário: Joyce Silva Saad
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Processo FAPESP: 20/04923-0 - Glicosilação do SARS-CoV-2 para identificação das características estruturais da COVID-19
• Beneficiário: Giuseppe Palmisano
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Processo FAPESP: 18/18257-1 - EMU concedido no processo 14/06863-3: sistema de cromatografia líquida configurado para análise de carboidratos, aminoácidos, peptídeos e glicoproteínas
• Beneficiário: Giuseppe Palmisano
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários
• Processo FAPESP: 18/15549-1 - Modificações pós-traducionais nos processos biológicos e no diagnóstico da Doença de Chagas: novas abordagens metodológicas e implicações biológicas
• Beneficiário: Giuseppe Palmisano
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores - Fase 2
• Processo FAPESP: 17/04032-5 - Dissecando a patogênese da Doença de Chagas através de abordagens glicômicas e glicoproteômicas
• Beneficiário: Simon Ngao Mule
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Processo FAPESP: 20/13562-0 - Desvendando o papel do imune checkpoint ligante CD200 na infecção do hospedeiro por Leishmania spp.
• Beneficiário: Mauro Javier Cortez Véliz
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Processo FAPESP: 21/14179-9 - O papel do retículo endoplasmático na virulência de infecções virais e parasitárias
• Beneficiário: Deivid Martins Santos
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Processo FAPESP: 18/13283-4 - Descoberta de potências biomarcadores da Doença de Chagas em urina utilizando técnicas de espectrometria de massas
• Beneficiário: Gilberto Santos de Oliveira
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado