Effect of genomic regions harboring putative lethal haplotypes on reproductive performance in closed experimental selection lines of Nellore cattle

Autor(es)

Rodrigues, Gustavo R. D. ; Cyrillo, Joslaine N. S. G. ; Mota, Lucio F. M. ; Schmidt, Patricia I. ; Valente, Julia P. S. ; Oliveira, Eduarda S. ; Albuquerque, Lucia G. ; Brito, Luiz F. ; Mercadante, Maria E. Z.

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: SCIENTIFIC REPORTS; v. 15, n. 1, p. 15-pg., 2025-02-03.

Resumo

Lethal alleles are mutations in the genome that cause embryonic losses in affected homozygous embryos and, therefore, can negatively influence reproduction rates in commercial populations. Thus, this study aimed to identify genomic regions containing potential lethal haplotypes in Nellore breed; identify candidate genes located within these regions; and investigate the reproductive performance of heterozygous carriers of lethal haplotypes in Nellore cattle. Forty-five genomic regions harboring putative lethal haplotypes were identified, which overlap with 360 genes. Gene ontology analyses of these genes revealed biological processes associated with the development of sexual traits in males and females, key functions of the immune system, energy homeostasis, and embryonic development. The gene networks were involved in metabolic pathways including ovarian steroidogenesis, oocyte meiosis, and insulin secretion. Matings between carrier dam and carrier sire led to a reduction of up to -203.46% in pregnancy success probability, an increase of 275.15% in probability of pregnancy loss, 295.03% for stillbirth occurrence, and 301.40% for pre-weaning mortality when compared to non-carrier dam and sire matings. The results highlight the importance of identifying animals that are carriers of lethal haplotypes to avoid the propagation of these haplotypes in the population. (AU)

• Processo FAPESP: 18/20026-8 - EMU concedido no processo 2017/10630-2: servidor
• Beneficiário: Lucia Galvão de Albuquerque
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários
• Processo FAPESP: 24/01909-7 - Varredura do genoma para regiões de distorção da taxa de transmissão e suas associações com aborto, natimorto e mortalidade pré-desmame em bovinos Nelore
• Beneficiário: Gustavo Roberto Dias Rodrigues
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Mestrado
• Processo FAPESP: 24/05697-4 - Estudo do efeito genético indireto da interação social sobre características obtidas em testes de eficiência alimentar de bovinos da raça Nelore
• Beneficiário: Júlia de Paula Soares Valente
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Processo FAPESP: 21/09942-5 - Estimativa da variância da diversidade gamética para características economicamente importantes de bovinos Nelore
• Beneficiário: Patrícia Iana Schmidt
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Processo FAPESP: 17/10630-2 - Aspectos genéticos da qualidade, eficiência e sustentabilidade da produção de carne em animais da raça Nelore
• Beneficiário: Lucia Galvão de Albuquerque
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Processo FAPESP: 23/11176-4 - Mapeamento de candidatos a haplótipos letais e regiões genômicas associadas a ocorrência de aborto e mortalidade pré-desmame em bovinos da raça Nelore
• Beneficiário: Gustavo Roberto Dias Rodrigues
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Processo FAPESP: 22/11852-7 - Modelo de equação estrutural como uma ferramenta para interpretar a interação genótipo-ambiente e estudos de associação genômica (GWAS) para características de crescimento e reprodução em novilhas da raça Nelore usando dados de sequência completa
• Beneficiário: Lúcio Flávio Macedo Mota
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 17/50339-5 - Plano de desenvolvimento institucional de pesquisa do Instituto de Zootecnia (PDIp)
• Beneficiário: Lenira El Faro Zadra
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Modernização de Institutos Estaduais de Pesquisa