Análise fenotípica, sequenciamento do genoma e transcriptoma de linhagens de Campylobacter coli isoladas de diversas fontes durante 16 anos no Brasil

Resumo

A campilobacteriose é uma zoonose de distribuição mundial com repercussões significativas no nível da Saúde Pública e com um elevado impacto socioeconômico. As espécies C. coli e C. jejuni são causas comuns de gastroenterite em humanos afetando anualmente cerca de 2,4 milhões de pessoas nos Estados Unidos e estima-se que 9 milhões de pessoas na Europa. Entretanto, no Brasil o estudo e o isolamento de C. coli não são muito frequentes, o que dificulta a avaliação da importância desse patógeno. Esse projeto tem como objetivos analisar comparativamente por testes fenotípicos, sequenciamento do genoma e transcriptoma 50 linhagens de C. coli isoladas de humanos, animais, ambiente e alimentos, entre 1995-2011 no Brasil. Serão realizados para todas as linhagens testes fenotípicos de flutuação da temperatura, resistência ao NaCl, stress ácido e oxidativo, invasão à células epiteliais, e multiplicação e sobrevivência em macrófagos de humanos e frangos. Será realizado o sequenciamento do genoma total de 12 linhagens de C. coli e o sequenciamento do transcriptoma (RNA seq) de duas linhagens de C. coli. Para a metodologia de RNA seq serão escolhidas duas linhagens de origem clínica e não clínica que apresentarem diferenças significativas frente aos testes fenotípicos acima citados. Os RNAs dessas linhagens serão extraídos após os ensaios de tolerância ao stress ácido e invasão a células CACO-2. Ademais, será realizada a determinação da dose letal média (DL50) de duas linhagens de C. coli. Devido à escassez de estudos envolvendo a espécie de C. coli, estudos que objetivem a elucidação dos mecanismos de patogenicidade e virulência são inéditos e de grande importância. Os resultados a serem obtidos deverão contribuir para a caracterização de C. coli isolados durante 16 anos no Brasil, colaborando para um melhor entendimento desse patógeno considerado de grande importância mundial.