Bolsa 18/07406-6 - Genética populacional, Anopheles darlingi

Processo:	18/07406-6
Modalidade de apoio:	Bolsas no Brasil - Mestrado
Data de Início da vigência:	01 de junho de 2018
Data de Término da vigência:	30 de abril de 2020
Área de conhecimento:	Ciências Biológicas - Parasitologia - Entomologia e Malacologia de Parasitos e Vetores
Acordo de Cooperação:	Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Pesquisador responsável:	Paulo Eduardo Martins Ribolla
Beneficiário:	Marcus Vinicius Niz Alvarez

Instituição Sede:	Instituto de Biotecnologia (IBTEC). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil

Assunto(s):	Genética populacional Anopheles darlingi Malária
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:	Anopheles darlingi \| Genética populacional \| Imputação de dados \| malária \| sequenciamento de baixa cobertura \| Bioinforática e Genética Populacional
Resumo Projetos que demandam por sequenciamento de genoma completo (WGS) em larga escala são muitas vezes impraticáveis devido ao custo da técnica quando aplicada em grande quantidade amostral. Sendo assim, estudos são necessários para encontrar novas estratégias viáveis e de baixo custo que podem ser adotadas para contornar a situação. O objetivo desse projeto será estudar diferentes métodos de obtenção de informações genômicas a partir de WGS de extrema-baixa cobertura (EXL-WGS) para estudo de populações. Larvas e adultos de Anopheles Darlingi em diferentes condições foram coletados no município de Mâncio Lima - AC. O protocolo de Nextera XT (Illumina) foi realizado com 1/5 do volume sugerido pelo protocolo padrão e o DNA sequenciado pelo NextSeq500 (Ilumina). Será realizado genotipagem por sequenciamento e imputação dos marcadores para estudo populacional, correlacionando com diferentes condições de coleta, tais como horário e localização da captura. (AU)

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Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

NIZ ALVAREZ, MARCUS VINICIUS; ALONSO, DIEGO PERES; KADRI, SAMIR MOURA; RUFALCO-MOUTINHO, PAULO; FERRARI BERNARDES, ISABELLA ARIADNE; FLORINDO DE MELLO, ANA CAROLINA; SOUTO, ANA CAROLINA; CARRASCO-ESCOBAR, GABRIEL; MORENO, MARTA; GAMBOA, DIONICIA; et al. Nyssorhynchus darlingi genome-wide studies related to microgeographic dispersion and blood-seeking behavior. PARASITES & VECTORS, v. 15, n. 1, p. 11-pg., 2022-03-28. (18/07406-6)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

ALVAREZ, Marcus Vinicius Niz. Análise de dados por imputação de sequenciamento de baixa cobertura: Seleção de marcadores e genética populacional.. 2020. Dissertação de Mestrado - Universidade Estadual Paulista (Unesp). Instituto de Biociências. Botucatu Botucatu.

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