Estudo de Associação Genômica para Escores Visuais Medidos à Desmama em Bovinos Nelore

• Processo: 19/04566-5
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2019
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2019
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Ricardo da Fonseca
• Beneficiário: Ricardo da Fonseca
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Tecnológicas. Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Dracena. Dracena , SP, Brasil
• Assunto(s): Genômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bayes C | Genes de Crescimento | LASSO Bayesiano | Genômica

Resumo

Os estudos de associação genômica ampla (GWAS) são utilizados em bovinos para identificar regiões ou variantes genéticas que estão associadas com os fenótipos de interesse, e assim, desenhar estratégias que permitam aumentar a frequência dos alelos favoráveis. Os escores visuais são caraterísticas importantes na bovinocultura do Brasil, porque são utilizados como critério de seleção, ajudando a escolher animais mais harmoniosos. Apesar de sua importância, ainda não há estudos de associação genômica para estas características. O objetivo do presente estudo foi identificar as regiões do genoma associadas com as características de conformação, precocidade e musculosidade, mensuradas à desmama. Para o GWAS foram utilizados fenótipos de 2873 animais da raça Nelore com os modelos BayesC e LASSO Bayesiano. Os animais foram genotipados com o painel BovineHD da Illumina, após o controle de qualidade um total de 309.865 SNPs foram utilizados. Nas análises, o fenótipo e os valores genéticos desregredidos foram utilizados como variável dependente, no primeiro caso foi utilizado um modelo "threshold", e no segundo foi utilizado um modelo linear. O critério de associação foi a porcentagem de variância genética explicada pelos SNPs contidos em janelas de 1 Mb de comprimento. O modelo BayesC foi o que se ajustou melhor aos dados porque conseguiu explicar uma maior proporção de variância fenotípica nas duas variáveis dependentes. Oa resultados mostraram que não houve janelas com grandes efeitos para os escores visuais, indicando que são de natureza poligênica, no entanto, foram identificadas nos cromossomos 1, 3, 5, 7, 14, 15, 16, 19, 20 e 23 regiões que explicaram maior variância genética. (AU)