| Processo: | 19/08514-0 |
| Modalidade de apoio: | Auxílio à Pesquisa - Regular |
| Data de Início da vigência: | 01 de setembro de 2019 |
| Data de Término da vigência: | 28 de fevereiro de 2022 |
| Área do conhecimento: | Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos |
| Pesquisador responsável: | Marilis Do Valle Marques |
| Beneficiário: | Marilis Do Valle Marques |
| Instituição Sede: | Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil |
| Município da Instituição Sede: | São Paulo |
| Pesquisadores associados: | Marcio Vinicius Bertacine Dias ; Tie Koide |
| Assunto(s): | Bactérias |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | bactérias | degradossomo de RNA | resposta a estresses | transporte de ferro | Resposta bacteriana a estresses |
Resumo
Caulobacter crescentus é uma alfa-proteobactéria oligotrófica que são importantes na reciclagem de matéria orgânica proveniente principalmente de material vegetal em decomposição. Esta bactéria é muito bem adaptada a sobreviver em condições de baixo teor nutricional e em baixa temperatura, e possui como diferencial um ciclo de diferenciação celular. Complexos multienzimáticos exercem funções vitais para a sobrevivência da célula, especialmente em condições de estresse, onde cada proteína do complexo tem uma função específica e colabora para o resultado final. Em baixa temperatura as moléculas de RNA tendem a formar estruturas secundárias estáveis, dificultando sua tradução e degradação, e as RNA helicases são ativadas, podendo estar associadas ao degradossomo de RNA. O degradossomo de RNA é um complexo multienzimático que atua como maquinário de processamento do RNA ribossômico e de degradação do mRNA, afetando assim a expressão gênica. O sistema TonB-ExbB-ExbD-Receptor é um complexo multienzimático envolvido na homeostase do ferro intracelular, responsável pela passagem de complexos sideróforo-ferro pela membrana externa da bactéria. O objetivo principal deste projeto é definir a participação de alguns participantes destes complexos proteicos nestes sistemas de C. crescentus. O papel das RNA helicases da família DEAD-box no processamento dos RNAs celulares será avaliado em diferentes condições de crescimento por analise transcriptomica global. Também serão identificados os RNAs, particularmente sRNAs e mRNAs, que interagem com o degradossomo, e será definido os sítios de interação da helicase com o degradossomo. Para estudar os sistemas de transporte de ferro, este projeto propõe definir os papeis de diferentes componentes destes sistemas, identificando o complexo férrico transportado, caracterizando a cinética de transporte, e determinando a estrutura e o papel de proteínas acessórias que ainda não foram estudadas. (AU)
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