Detecção de transposases codificadas por Sequências de Inserção usando dados de proteômica

Resumo

Nosso projeto principal tem como objetivo a identificação dos componentes da regulação de sequências de inserção em Halobacterium salinarum, principalmente aqueles que agem no nível pós-transcricional. Identificamos diversos RNAs codificadores de transposase que se acoplam à proteína LSm, a qual pode reprimir ou induzir a tradução de transcritos. Quantificamos a mobilização de sequências de inserção após remover a proteína LSm do sistema e notamos diferenças quando comparamos o mutante nulo à linhagem controle. Este experimento revelou sequências de inserção ativas que podem ser exploradas em maior profundidade, porém atualmente possuímos apenas dados de genômica e transcriptômica. Neste projeto, propomos a integração de dados de proteômica aos nossos achados para melhor caracterizar o mobiloma de H. salinarum. Pretendemos checar quais sequências de inserção produzem proteínas e correlacionar a sua quantidade com os elementos ativos identificados. Além disso, esperamos analisar dados de H. salinarum cultivada em diversas condições para checar se a expressão de transposases é responsiva às variações ambientais. Durante a execução deste projeto, esperamos obter ganhos não só para o projeto principal, mas também para o desenvolvimento profissional do estudante.