| Processo: | 19/13440-5 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 18 de outubro de 2019 |
| Data de Término da vigência: | 17 de outubro de 2020 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular |
| Pesquisador responsável: | Tie Koide |
| Beneficiário: | Alan Péricles Rodrigues Lorenzetti |
| Supervisor: | Nitin Surendranatha Baliga |
| Instituição Sede: | Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil |
| Instituição Anfitriã: | Institute for Systems Biology, Estados Unidos |
| Vinculado à bolsa: | 17/03052-2 - RNAs não codificantes derivados de sequências de inserção na arqueia halófila Halobacterium salinarum NRC-1, BP.DR |
| Assunto(s): | Transposases Biologia computacional Halobacterium salinarum Proteômica Archaea |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Archaea | bioinformática | Halobacterium salinarum | proteômica | Sequências de inserção | Transposases | Microbiologia, Bioinformática |
Resumo Nosso projeto principal tem como objetivo a identificação dos componentes da regulação de sequências de inserção em Halobacterium salinarum, principalmente aqueles que agem no nível pós-transcricional. Identificamos diversos RNAs codificadores de transposase que se acoplam à proteína LSm, a qual pode reprimir ou induzir a tradução de transcritos. Quantificamos a mobilização de sequências de inserção após remover a proteína LSm do sistema e notamos diferenças quando comparamos o mutante nulo à linhagem controle. Este experimento revelou sequências de inserção ativas que podem ser exploradas em maior profundidade, porém atualmente possuímos apenas dados de genômica e transcriptômica. Neste projeto, propomos a integração de dados de proteômica aos nossos achados para melhor caracterizar o mobiloma de H. salinarum. Pretendemos checar quais sequências de inserção produzem proteínas e correlacionar a sua quantidade com os elementos ativos identificados. Além disso, esperamos analisar dados de H. salinarum cultivada em diversas condições para checar se a expressão de transposases é responsiva às variações ambientais. Durante a execução deste projeto, esperamos obter ganhos não só para o projeto principal, mas também para o desenvolvimento profissional do estudante. | |
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