Morcegos: vigilância epidemiológica, filodinâmica de alta resolução, busca e design de peptídeos de interesse biotecnológico em vírus emergentes e reemergentes

• Processo: 19/01255-9
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
• Vigência: 01 de maio de 2021 - 30 de abril de 2026
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Medicina Veterinária - Medicina Veterinária Preventiva
• Pesquisador responsável: Ricardo Durães de Carvalho
• Beneficiário: Ricardo Durães de Carvalho
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 23/04038-4 - Vigilância epidemiológica e princípios de evolução molecular viral na investigação de Coronavírus, Influenza A e Arbovírus em morcegos provenientes de diferentes regiões do Estado de São Paulo, BP.MS; 22/12858-9 - Filogenia e evolução molecular dos Vírus Chikungunya (CHIKV), Dengue (DENVs) e Zika (ZIKV): identificação, design e validação de peptídeos de interesse biotecnológico, BP.DD; 22/12861-0 - Filodinâmica de alta resolução e sua aplicação translacional no contexto biotecnológico: identificação, design e validação de peptídeos do SARS-CoV-2 (COVID-19), Mayaro (MAYV), Oropouche (OROV) e da Febre Amarela (YFV), BP.DD; + mais bolsas vinculadas 22/08748-3 - Investigação de vírus emergentes e reemergentes em espécimes de morcegos capturados em diferentes regiões do Estado de São Paulo, BP.TT; 22/09684-9 - Investigação de vírus emergentes e reemergentes em amostras de suabes (oral/anal) de morcegos capturados em diferentes regiões do Estado de São Paulo, BP.TT; 21/03684-4 - Morcegos: vigilância epidemiológica, filodinâmica de alta resolução, busca e design de peptídeos de interesse biotecnológico em vírus emergentes e reemergentes, BP.JP - menos bolsas vinculadas
• Assunto(s): Virologia Morcegos Vírus de RNA Peptídeos Monitoramento epidemiológico Metagenômica Sequenciamento de nova geração Zoonoses por vírus Infecções por Arbovirus
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: filodinamica | Morcegos | peptídeos | Vigilância Epidemiológica | Vírus RNA | Virologia

Resumo

Vírus RNA são importantes agentes envolvidos em zoonoses emergentes e reemergentes, representando um importante problema de Saúde Pública. Este cenário vem sendo constantemente monitorado através de descobertas de novos patógenos, no qual, entra em consonância e interesse internacional visando a identificação de novos agentes com o intuito de responder às novas doenças antes de atingirem à população humana. Neste contexto, os morcegos, com um viroma ainda a ser acentuadamente explorado, cada vez mais vêm recebendo notória atenção por albergar diversos patógenos virais de importância médica (ex.: Nipah, Ebola, SARS-CoV, MERS-CoV e agora o SARS-CoV-2 [COVID-19] pandêmico). Por outro lado, destacam-se os arbovírus, também detectados em morcegos. A saber, Chikungunya (CHIKV), Dengue 1-4 (DENVs), Mayaro (MAYV), Oropouche (OROV), Febre Amarela (YFV) e Zika (ZIKV), responsáveis por mais de 95% dos casos de infecção em todo o território brasileiro. Digno de nota, pesquisas mostram que kits diagnósticos comercialmente disponíveis para a detecção do CHIKV, DENV e ZIKV possuem grandes limitações e que o problema é agravado quanto se trata dos agentes reemergentes: MAYV, OROV e YFV. A presente proposta focará na investigação da presença de vírus RNA em morcegos e em abordagens envolvendo metagenômica e tecnologias de Sequenciamento de Nova Geração (NGS) objetivando identificar novos agentes de importância zoonótica assim como novos agentes arbovirais. Em paralelo, será implementada uma abordagem pioneira através do estado-da-arte da filodinâmica utilizando a Computação de Alta Performance (HPC), fornecendo assim estratégias para o desenvolvimento de plataformas e workflows para o mapeamento e validação de peptídeos alvo-específicos com finalidade diagnóstica e terapêutica. (AU)

Publicações científicas

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(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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LOEFFLER, FELIX F.; VIANA, ISABELLE F. T.; FISCHER, NICO; COELHO, DANILO F.; SILVA, CAROLINA S.; PURIFICACAO, JR., ANTONIO F.; ARAUJO, CATARINA M. C. S.; LEITE, BRUNO H. S.; DURAES-CARVALHO, RICARDO; MAGALHAES, TEREZA; et al. Identification of a Zika NS2B epitope as a biomarker for severe clinical phenotypes. RSC MEDICINAL CHEMISTRY, v. 12, n. 9, JUL 2021. (19/01255-9)

ANDREATA-SANTOS, ROBERT; JANINI, LUIZ M. R.; DURAES-CARVALHO, RICARDO. From Alpha to Omicron SARS-CoV-2 variants: What their evolutionary signatures can tell us?. Journal of Medical Virology, JAN 2022. (21/03684-4, 19/01255-9, 21/05661-1, 20/08943-5)

DOS SANTOS PEREIRA ANDRADE, ANA CLAUDIA; CAMPOLINA-SILVA, GABRIEL HENRIQUE; QUEIROZ-JUNIOR, CELSO MARTINS; DE OLIVEIRA, LEONARDO CAMILO; LACERDA, LARISSE DE SOUZA BARBOSA; PIMENTA GAGGINO, JORDANE CLARISSE; OLIVEIRA DE SOUZA, FILIPE RESENDE; CHAVES, IAN DE MEIRA; PASSOS, INGREDY BEATRIZ; TEIXEIRA, DANIELLE CUNHA; et al. A Biosafety Level 2 Mouse Model for Studying Betacoronavirus- Induced Acute Lung Damage and Systemic Manifestations. Journal of Virology, v. 95, n. 22, NOV 2021. (19/01255-9)