| Processo: | 07/53097-0 |
| Modalidade de apoio: | Auxílio à Pesquisa - Regular |
| Data de Início da vigência: | 01 de julho de 2007 |
| Data de Término da vigência: | 31 de dezembro de 2009 |
| Área do conhecimento: | Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal |
| Acordo de Cooperação: | CNRS |
| Pesquisador responsável: | Claudia Marcia Aparecida Carareto |
| Beneficiário: | Claudia Marcia Aparecida Carareto |
| Pesquisador Responsável no exterior: | Cristina Vieira |
| Instituição Parceira no exterior: | Université Claude Bernard Lyon 1, França |
| Instituição Sede: | Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil |
| Assunto(s): | Genomas Drosophila |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Deterioracao | Dinamica Evolutiva | Drosophila | Helena | Retroposons |
Resumo
O elemento transponível Helena propicia uma oportunidade única para compreender a dinâmica de aquisição e perda de elementos em um genoma, já que em D. melanogaster há uma provável inativação desse retroposon e em D. simulans, uma atividade potencial do elemento. Além disso Drosophila é um excelente modelo de estudo, pois a quantidade de elementos é suficientemente pequena para permitir estudos exaustivos e completos. Para compreender o processo dinâmico de aquisição e perda de Helena nos genomas, este trabalho tem os objetivos de analisar a ocorrência do elemento Helena, in silico e em populações naturais, de 12 espécies de Drosophila (D. melanogaster, D. simulans, D. yakuba, D. erecta, D. sechellia, D. ananassae, D. persimilis, D. pseudoobscura, D. virilis, D. mojavensis, D. grimshawi, D. willistoni). As análises de Bionformática permitirão descrever o número de inserções de Helena no genomas, a diversidade nucleotidica, as relações evolutivas. e: o grau de deterioração entre cópias da mesma espécie e entre espécies. As análises populacionais de D. simulans e de D. melanogaster, como também de espécies subgrupo melanogaster e de D. virilis por meio de Southern blot permitirá detectar possíveis cópias completas e analisar sua expressão por meio de RT-PCR e Northern blot. Com esse estudo, sobretudo pelas análises populacionais em espécies irmãs (D. melanogaster e D. simulans), mas que apresentam dinâmica diferente de evolução do retroposon Helena, poderemos compreender como as modificações da estrutura e a composição desse elemento, um fenômeno que ocorre em etapas e velocidades variáveis em diferentes espécies. Com este tipo de análise comparativa poderemos compreender como o elemento Helena, em particular, e os retroposons em geral, são adquiridos e perdidos pelas espécies e como características, tais como os sítios de inserção, o genoma hospedeiro e o tempo de integração das cópias completas no genoma hospedeiro relacionam-se com a sua dinâmica evolutiva. (AU)
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