Identificação de biomarcadores para diagnóstico molecular do adenocarcinoma ductal do pâncreas através da análise com alta-resolução do transcritoma e exoma

• Processo: 13/13844-2
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2014
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2016
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Eduardo Moraes Rego Reis
• Beneficiário: Eduardo Moraes Rego Reis
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Fernando Augusto Soares ; João Carlos Setubal ; José Celso Ardengh ; Maria Dirlei Ferreira de Souza Begnami ; Renata de Almeida Coudry
• Assunto(s): Neoplasias pancreáticas Carcinoma ductal pancreático Biomarcadores tumorais Exoma Transcriptoma Sequenciamento de nucleotídeos em larga escala RNA não traduzido
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: cancer de pancreas | exoma | marcadores moleculares | RNAs nãocodificadores | Sequenciamento em larga-escala | transcritoma | oncogenômica

Resumo

O câncer de pâncreas é uma das neoplasias mais letais e apenas 5% dos indivíduos afetados sobrevivem mais do que 5 anos após o diagnóstico. Isto se deve tanto à dificuldade em se obter um diagnóstico precoce, quanto à ausência de opções terapêuticas efetivas. O adenocarcinoma ductal (PDAC) é o tipo mais prevalente, sendo extremamente agressivo, e o único tratamento curativo disponível é a remoção cirúrgica do tumor se detectado em estádios iniciais da doença. Tumores císticos do pâncreas podem progredir para adenocarcinomas invasivos e atualmente não existem marcadores capazes de predizer com segurança sua evolução clínica. Para que o tratamento destas neoplasias se torne mais efetivo, é vital a identificação de novos biomarcadores que possibilitem o diagnóstico precoce da doença ou que permitam determinar o risco de lesões císticas evoluírem para tumores invasivos. Nesta proposta iremos estabelecer uma plataforma analítica para identificar alterações no perfil de expressão de RNAs (transcritoma) e na sequência de DNA (exoma) através do sequenciamento de alta-capacidade de RNA/DNA proveniente de amostras clínicas de tumores pancreáticos. Um aspecto original da proposta será a análise de RNAs não codificadores longos poliadenilados e não poliadenilados expressos em amostras de PDAC, lesões pré malignas e tecido pancreático não tumoral. Outro aspecto inovador será a utilização de biópsias de tumores de pâncreas obtidas através de ecoendoscopia aspirativa por agulha fina (EUS-FNA), um método minimamente invasivo, para a detecção de alterações somáticas no exoma. Investigaremos também o potencial diagnóstico de RNAs isolados de amostras do plasma e de líquido cístico de pacientes com tumores císticos de pâncreas. A análise integrada dos dados permitirá identificar genes, vias moleculares e módulos funcionais preferencialmente afetados por alterações somáticas ou transcricionais durante a transformação maligna e progressão de tumores de pâncreas. RNAs diferencialmente expressos e mutações somáticas com potencial relevância diagnóstica/clínica serão selecionados para avaliação em um painel independente de amostras de pacientes. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DA PAIXAO, VINICIUS FERREIRA; SOSA, OMAR JULIO; DA SILVA PELLEGRINA, DIOGO VIEIRA; DAZZANI, BIANCA; CORREA, THALITA BUENO; BERTOLDI, ESTER RISERIO; DA CRUZ E ALVES-DE-MORAES, LUIS BRUNO; PESSOA, DIOGO DE OLIVEIRA; OLIVEIRA, VICTORIA DE PAIVA; CHIONG ZEVALLOS, RICARDO ALBERTO; et al. Annotation and functional characterization of long noncoding RNAs deregulated in pancreatic adenocarcinoma. CELLULAR ONCOLOGY, v. 45, n. 3, p. 26-pg., 2022-05-14. (13/13844-2, 16/19757-2)