Resumo
Os estudos de correlação estrutura-função em hidrolases glicosídicas permitem desvendar diversas estratégias para termoestabilidade, especificidade e modulação - conhecimentos que podem ser empregados para o desenvolvimento do uso otimizado dessas enzimas em processos biotecnológicos, além de subsidiarem o desenho racional de enzimas. Porém, estudos mais aprofundados quanto aos determinantes estruturais para os diversos modos de ação dessas enzimas sobre os substratos, que seria um próximo passo nas investigações, estão limitados ao fato de não se conhecer os modos de ataque ao substrato e seus produtos formados. A caracterização dos produtos de clivagem aliado com estudos de mutagênese sítio-dirigida e a estrutura tridimensional permitem elucidar as bases moleculares do modo de ação dessas enzimas e fornece um entendimento além do que as atuais ferramentas disponíveis permitem. O principal experimento que será rotineiramente realizado neste equipamento é a análise de produtos de reação de hidrolases glicosídicas e para isso, os produtos serão marcados com APTS, uma molécula fluorescente. Assim, para sua detecção é estritamente necessário o acoplamento de um módulo de excitação e detecção de fluorescência. Uma grande variedade de enzimas inéditas tem sido descobertas seja pelo sequenciamento de novos genomas bem como por abordagens metagenômicas e o entendimento dos produtos formados com a caracterização bioquímica e cinética seria crucial para avaliar o potencial biotecnológico dessas enzimas. Hoje o estado-da-arte em estudos sobre aspectos funcionais e estruturais de GHs, tem como pontos fortes a determinação da estrutura tridimensional das enzimas conjugado com uma caracterização funcional detalhada, o que inclui impreterivelmente análise de produtos de clivagem de enzimas selvagens e mutantes. Com este equipamento serão alcançados resultados mais aprofundados e de melhor qualidade no ponto de vista da mecanística dessas enzimas. O Laboratório Automatizado de Cristalização de Proteínas já é uma realidade no LNBio e aliado às estruturas tridimensionais obtidas, poderão ser alcançados novos resultados sobre o modo de ação de enzimas glicosídicas com o novo Sistema de Eletroforese Capilar. Esta aquisição irá ampliar e integrar a capacidade de pesquisa do LNBio, bem como de outras Universidades e Instituições interessadas. (AU)
Publicações científicas
(6)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DOS SANTOS, CAMILA RAMOS;
DE GIUSEPPE, PRISCILA OLIVEIRA;
MOREIRA DE SOUZA, FLAVIO HENRIQUE;
ZANPHORLIN, LETICIA MARIA;
DOMINGUES, MARIANE NORONHA;
SIQUEIRA PIROLLA, RENAN AUGUSTO;
HONORATO, RODRIGO VARGAS;
COSTA TONOLI, CELISA CALDANA;
BUENO DE MORAIS, MARIANA ABRAHAO;
DE MATOS MARTINS, VANESA PEIXOTO;
FONSECA, LUCAS MIRANDA;
BUCHLI, FERNANDA;
LOPES DE OLIVEIRA, PAULO SERGIO;
GOZZO, FABIO CESAR;
MURAKAMI, MARIO TYAGO.
The mechanism by which a distinguishing arabinofuranosidase can cope with internal di-substitutions in arabinoxylans.
BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS,
v. 11,
AUG 11 2018.
Citações Web of Science: 2.
ZANPHORLIN, LETICIA MARIA;
DE GIUSEPPE, PRISCILA OLIVEIRA;
HONORATO, RODRIGO VARGAS;
COSTA TONOLI, CELISA CALDANA;
FATTORI, JULIANA;
CRESPIM, ELAINE;
LOPES DE OLIVEIRA, PAULO SERGIO;
RULLER, ROBERTO;
MURAKAMI, MARIO TYAGO.
Oligomerization as a strategy for cold adaptation: Structure and dynamics of the GH1 beta-glucosidase from Exiguobacterium antarcticum B7.
SCIENTIFIC REPORTS,
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Citações Web of Science: 20.
CRESPIM, ELAINE;
ZANPHORLIN, LETICIA M.;
DE SOUZA, FLAVIO H. M.;
DIOGO, JOSE A.;
GAZOLLA, ALEX C.;
MACHADO, CARLA B.;
FIGUEIREDO, FERNANDA;
SOUSA, AMANDA S.;
NOBREGA, FELIPE;
PELLIZARI, VIVIAN H.;
MURAKAMI, MARIO T.;
RULLER, ROBERTO.
A novel cold-adapted and glucose-tolerant GH1 beta-glucosidase from Exiguobacterium antarcticum B7.
International Journal of Biological Macromolecules,
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Citações Web of Science: 14.
DIOGO, JOSE ALBERTO;
ZANPHORLIN, LETICIA MARIA;
SATO, HELIA HARUMI;
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Molecular cloning, overexpression, purification and crystallographic analysis of a GH43-xylosidase from Bacillus licheniformis.
ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS,
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Citações Web of Science: 1.
FURTADO, GILVAN P.;
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RIBEIRO, LUCAS F.;
DE MORAES, LUIZ A. B.;
DAMASIO, ANDR R. L.;
POLIZELI, MARIA DE LOURDES T. M.;
LOURENZONI, MARCOS R.;
MURAKAMI, MARIO T.;
WARD, RICHARD J.
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Citações Web of Science: 9.
SANTOS, CAMILA RAMOS;
HOFFMAM, ZAIRA BRUNA;
DE MATOS MARTINS, VANESA PEIXOTO;
ZANPHORLIN, LETICIA MARIA;
DE PAULA ASSIS, LEANDRO HENRIQUE;
HONORATO, RODRIGO VARGAS;
LOPES DE OLIVEIRA, PAULO SERGIO;
RULLER, ROBERTO;
MURAKAMI, MARIO TYAGO.
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