Análise do transcriptoma do desenvolvimento embrionário de fêmeas de Apis mellifera

• Processo: 10/08332-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2010
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2014
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Zilá Luz Paulino Simões
• Beneficiário: Flávia Cristina de Paula Freitas
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 12/02061-4 - Validação das interações entre miRNAs e mRNAs-alvo envolvidas na formação do sistema nervoso em embriões fêmeos de Apis mellifera, BE.EP.DR
• Assunto(s): Genética do desenvolvimento Abelhas Apis mellifera Embriogênese MicroRNAs Transcriptoma Sequenciamento de nova geração
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Apis mellifera | Desenvolvimento embrionário | MicroRNAs | Next Generation Sequencing | Transcriptoma | Genética do desenvolvimento

Resumo

Os mecanismos que controlam a expressão dos genes operam em muitos níveis e podem ocorrer antes da transcrição, após a transcrição e após a tradução. Em 1993, foi descoberta uma nova classe de moléculas reguladoras que atuam após a transcrição gênica: os RNAs não-codificadores. Os microRNAs (miRNAs) são moléculas de RNA não-codificador que após processado têm de 20-23 nucleotídeos. A molécula de miRNA madura se une ao complexo proteico RISC e dirige a regulação negativa da expressão dos mRNAs-alvo. Em Drosophila melanogaster sabe-se que os miRNAs participam de processos regulados no desenvolvimento e interferem em importantes processos biológicos como apoptose, divisão celular e oogênese. Abordagens computacionais têm sido desenvolvidas para identificar os mRNAs-alvo dos miRNAs e assim fornecer pistas sobre a função do miRNA baseando-se no papel descrito para os alvos. Muitos organismos já tiveram seu transcriptoma sequenciado, entre eles D. melanogaster e Bombyx mori. Para as abelhas A. mellifera, foi feita uma análise computacional que identificou 65 candidatos a miRNAs. No entanto, nenhum estudo em larga escala do transcriptoma foi feito para as abelhas A. mellifera. O principal objetivo desse projeto é sequenciar o transcriptoma do desenvolvimento embrionário de fêmeas de A. mellifera usando o sistema AB SOLiD (Applied Biosystems, Life Technologies). O sequenciamento de RNAs em larga escala extraídos em diferentes estágios do desenvolvimento é uma ferramenta poderosa não apenas para medir as mudanças no perfil dos transcritos, mas também para descobrir miRNAs específicos da espécie. A validação das análises computacionais será feita por PCR em tempo real dos genes (miRNAs e mRNAs-alvo) da cascata de determinação do sexo no desenvolvimento embrionário de fêmeas e machos de A. mellifera. O conhecimento das interações gênicas que modulam a embriogênese de A. mellifera permitirá a proposta de um modelo genético de desenvolvimento, através da análise das categorias funcionais dos principais genes. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

FREITAS, FLAVIA C. P.; PIRES, CAMILLA V.; CLAUDIANOS, CHARLES; CRISTINO, ALEXANDRE S.; SIMOES, ZILA L. P.. MicroRNA-34 directly targets pair-rule genes and cytoskeleton component in the honey bee. SCIENTIFIC REPORTS, v. 7, JAN 18 2017. (10/08150-3, 11/03171-5, 12/02061-4, 10/08332-4)

LOURENCO, ANETE P.; GUIDUGLI-LAZZARINI, KARINA R.; FREITAS, FLAVIA C. P.; BITONDI, MARCIA M. G.; SIMOES, ZILA L. P.. Bacterial infection activates the immune system response and dysregulates microRNA expression in honey bees. Insect Biochemistry and Molecular Biology, v. 43, n. 5, p. 474-482, MAY 2013. (10/08332-4, 11/03171-5, 03/07041-2, 11/10133-2)