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Transcriptome analysis of embryonic development in Apis mellifera females

Grant number: 10/08332-4
Support Opportunities:Scholarships in Brazil - Doctorate
Start date: July 01, 2010
End date: July 31, 2014
Field of knowledge:Biological Sciences - Genetics - Animal Genetics
Principal Investigator:Zilá Luz Paulino Simões
Grantee:Flávia Cristina de Paula Freitas
Host Institution: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brazil
Associated scholarship(s):12/02061-4 - Validation of miRNAs and mRNAs-target interactions involved in nervous system development in female embryos of Apis mellifera, BE.EP.DR

Abstract

Os mecanismos que controlam a expressão dos genes operam em muitos níveis e podem ocorrer antes da transcrição, após a transcrição e após a tradução. Em 1993, foi descoberta uma nova classe de moléculas reguladoras que atuam após a transcrição gênica: os RNAs não-codificadores. Os microRNAs (miRNAs) são moléculas de RNA não-codificador que após processado têm de 20-23 nucleotídeos. A molécula de miRNA madura se une ao complexo proteico RISC e dirige a regulação negativa da expressão dos mRNAs-alvo. Em Drosophila melanogaster sabe-se que os miRNAs participam de processos regulados no desenvolvimento e interferem em importantes processos biológicos como apoptose, divisão celular e oogênese. Abordagens computacionais têm sido desenvolvidas para identificar os mRNAs-alvo dos miRNAs e assim fornecer pistas sobre a função do miRNA baseando-se no papel descrito para os alvos. Muitos organismos já tiveram seu transcriptoma sequenciado, entre eles D. melanogaster e Bombyx mori. Para as abelhas A. mellifera, foi feita uma análise computacional que identificou 65 candidatos a miRNAs. No entanto, nenhum estudo em larga escala do transcriptoma foi feito para as abelhas A. mellifera. O principal objetivo desse projeto é sequenciar o transcriptoma do desenvolvimento embrionário de fêmeas de A. mellifera usando o sistema AB SOLiD (Applied Biosystems, Life Technologies). O sequenciamento de RNAs em larga escala extraídos em diferentes estágios do desenvolvimento é uma ferramenta poderosa não apenas para medir as mudanças no perfil dos transcritos, mas também para descobrir miRNAs específicos da espécie. A validação das análises computacionais será feita por PCR em tempo real dos genes (miRNAs e mRNAs-alvo) da cascata de determinação do sexo no desenvolvimento embrionário de fêmeas e machos de A. mellifera. O conhecimento das interações gênicas que modulam a embriogênese de A. mellifera permitirá a proposta de um modelo genético de desenvolvimento, através da análise das categorias funcionais dos principais genes. (AU)

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Scientific publications
(The scientific publications listed on this page originate from the Web of Science or SciELO databases. Their authors have cited FAPESP grant or fellowship project numbers awarded to Principal Investigators or Fellowship Recipients, whether or not they are among the authors. This information is collected automatically and retrieved directly from those bibliometric databases.)
LOURENCO, ANETE P.; GUIDUGLI-LAZZARINI, KARINA R.; FREITAS, FLAVIA C. P.; BITONDI, MARCIA M. G.; SIMOES, ZILA L. P.. Bacterial infection activates the immune system response and dysregulates microRNA expression in honey bees. Insect Biochemistry and Molecular Biology, v. 43, n. 5, p. 474-482, . (10/08332-4, 11/03171-5, 11/10133-2)
FREITAS, FLAVIA C. P.; PIRES, CAMILLA V.; CLAUDIANOS, CHARLES; CRISTINO, ALEXANDRE S.; SIMOES, ZILA L. P.. MicroRNA-34 directly targets pair-rule genes and cytoskeleton component in the honey bee. SCIENTIFIC REPORTS, v. 7, . (10/08150-3, 11/03171-5, 12/02061-4, 10/08332-4)