Tratamento, análise e gerenciamento de bases de dados referentes ao processo de sequenciamento de genes em tecnologia de última geração (SOLID 4)

• Processo: 11/10350-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2011
• Data de Término da vigência: 29 de fevereiro de 2012
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Carlos Frederico Martins Menck
• Beneficiário: Francisco Ivanio Arruda Alves
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 09/52417-7 - Respostas celulares a lesões no genoma, AP.TEM
• Assunto(s): Biologia computacional Ferimentos e lesões DNA Análise de sequência de DNA Reparo do DNA Banco de dados Bases de dados
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Dna | lesões | Reparo | sequenciamento | Xeroderma Pigmentosum | Bioinformática

Resumo

Este plano prevê que o aluno indicado desenvolva atividades de infraestrutura no laboratório, dando suporte técnico no que compete à área bioinformática, construindo ferramentas computacionais de análise e suporte ao sequenciamento de DNA, tratando as informações e as fornecendo em interfaces mais adaptadas às experiências e necessidades dos demais pesquisadores do laboratório de Reparo de DNA, e mesmo para outros laboratórios do Depto. de Microbiologia. Espera-se também do aluno a manutenção e gerenciamento dos bancos de dados referentes ao projeto elaborando meios de acesso controlados aos mesmos. Acreditamos que essas atividades podem contribuir para o aprendizado de algumas técnicas empregadas usualmente no laboratório, assim como para o bom funcionamento do trabalho científico deste.