Descoberta e validação de pequenos RNAs preditivos de agressividade em câncer de mama

• Processo: 11/04399-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2011
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2013
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Emmanuel Dias-Neto
• Beneficiário: Gabriela Pereira Branco
• Instituição Sede: Hospital A C Camargo. Fundação Antonio Prudente (FAP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Oncologia Neoplasias mamárias RNA mensageiro Análise de sequência de DNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: câncer | mama | marcadores de agressividade | miRNAs | pequenos RNAs | sequenciamento de larga-escala | Oncologia

Resumo

O câncer de mama é a segunda causa de morte em mulheres no mundo. Infelizmente, os poucos marcadores moleculares usados na rotina diagnóstica ainda são insuficientes para permitir decisões clínico-cirúrgicas mais adequadas, e a heterogeneidade genética das pacientes e dos tumores limita a capacidade de predição da evolução clínica da doença. Deste modo, os estudos que buscam identificar marcadores de agressividade tumoral ainda estão entre os mais relevantes na pesquisa oncológica atual. Neste projeto investigaremos o possível papel de pequenos RNAs - incluindo microRNAs (miRNAs), small nuclear RNAs (snRNAs) e small nucleolar RNAs (snoRNAS) - como marcadores de agressividade tumoral em câncer de mama. Para isto, estes pequenos RNAs serão extraídos de amostras de tumores obtidos de 50 mulheres com câncer de mama ductal invasivo (Her2+, PR- e ER-), separadas em dois grupos polares de agressividade, devidamente pareadas por idade, tipo tumoral, status linfonodal e expressão de citoqueratinas. Bibliotecas serão construídas com estes pequenos RNAs - com a adição de tags que permitam a identificação de origem da amostra - e sequenciadas em larga-escala na plataforma SOLiD 4.0. As sequências obtidas serão mapeadas e analisadas quantitativa e qualitativamente, de modo a permitir inferir a expressão de cada uma das espécies de pequenos RNAs encontradas nestes tumores. Os pequenos RNAs com maior e mais consistente expressão diferencial serão confirmados por PCR em tempo real (qPCR), seguidas de validação em um painel de linhagens de celulares de câncer de mama com características distintas de migração, invasão e formação de metástases. Deste modo, esperamos contribuir com a descoberta de novas moléculas de pequenos RNAs e novos potenciais marcadores de agressividade em câncer de mama. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

GABRIELA PEREIRA BRANCO; RENAN VALIERIS; LUCAS VENEZIAN POVOA; LUIZA FERREIRA DE ARAÚJO; GUSTAVO RIBEIRO FERNANDES; JORGE ESTEFANO SANTANA DE SOUZA; MARIA GALLI DE AMORIM; ELISA NAPOLITANO E FERREIRA; ISRAEL TOJAL DA SILVA; DIANA NORONHA NUNES; et al. A comparison between SOLiD 5500XLand Ion Torrent PGM-derived miRNA expression profiles in two breast cell lines. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 43, n. 2, 2020-04-27. (11/04399-0, 14/26897-0)

DE AMORIM, MARIA GALLI; BRANCO, GABRIELA; VALIERIS, RENAN; TARCITANO, EMILIO; DA SILVA, ISRAEL TOJAL; DE ARAUJO, LUIZA FERREIRA; NUNES, DIANA NORONHA; DIAS-NETO, EMMANUEL. The impact of HER2 overexpression on the miRNA and circRNA transcriptomes in two breast cell lines and their vesicles. PHARMACOGENOMICS, v. 20, n. 7, p. 493-502, MAY 2019. (14/26897-0, 17/20278-4, 11/04399-0)

BRANCO, GABRIELA PEREIRA; VALIERIS, RENAN; POVOA, LUCAS VENEZIAN; DE ARAUJO, LUIZA FERREIRA; FERNANDES, GUSTAVO RIBEIRO; SANTANA DE SOUZA, JORGE ESTEFANO; DE AMORIM, MARIA GALLI; NAPOLITANO E FERREIRA, ELISA; DA SILVA, ISRAEL TOJAL; NUNES, DIANA NORONHA; et al. A comparison between SOLiD 5500XL-and Ion Torrent PGM-derived miRNA expression profiles in two breast cell lines. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 43, n. 2, 2020. (11/04399-0, 14/26897-0)