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Caracterização de rearranjos cromossômicos aparentemente equilibrados e sua relação com o fenótipo dos portadores

Processo: 11/14293-4
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de novembro de 2011
Vigência (Término): 31 de outubro de 2015
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
Pesquisador responsável:Angela Maria Vianna Morgante
Beneficiário:Ana Carolina dos Santos Fonseca
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:98/14254-2 - Centro de Estudos do Genoma Humano, AP.CEPID
Bolsa(s) vinculada(s):13/01146-9 - Caracterização de rearranjos cromossômicos aparentemente equilibrados e sua relação com o fenótipo dos portadores: sequenciamento dos pontos de quebra e junção por mate-pair sequencing, BE.EP.DR
Assunto(s):Estudos de associação genética   Deficiência mental   Citogenética molecular

Resumo

A maioria dos portadores de rearranjos cromossômicos aparentemente equilibrados são clinicamente normais, mas 7% desses rearranjos estão associados a alterações fenotípicas. Interrupção de gene pelas quebras, modificação da expressão gênica decorrente de efeito de posição, formação de gene híbrido e dissomia uniparental são mecanismos classicamente propostos para explicar o efeito patogênico de rearranjos aparentemente equilibrados. Recentemente, foi mostrado que deleções e duplicações submicroscópicas nos cromossomos rearranjados podem explicar os fenótipos alterados. Esses desequilíbrios submicroscópicos também têm sido identificados, como mutações de novo, em rearranjos equilibrados associados a patologias, mas que foram herdados de genitores fenotipicamente normais. Com este projeto, nosso objetivo é identificar mecanismos pelos quais rearranjos aparentemente equilibrados possam estar associados de maneira causal a determinados quadros clínicos. Pretendemos também contribuir para a compreensão dos mecanismos de formação dos rearranjos equilibrados. Serão estudados rearranjos esporádicos ou herdados de genitores fenotipicamente normais, detectados em indivíduos com alterações do desenvolvimento de etiologia desconhecida. O estudo incluirá ainda rearranjos aparentemente equilibrados presentes em indivíduos sem histórico de doença de aparecimento precoce. A caracterização desse tipo de rearranjo, evidenciando no que diferem daqueles presentes em indivíduos afetados, visa contribuir para a compreensão das alterações associadas de maneira causal a quadros clínicos. Os pontos de quebra dos rearranjos serão mapeados por FISH. A busca por microdeleções e duplicações genômicas será realizada por a-CGH. A origem parental dos desequilíbrios submicroscópios não herdados, será determinada pela análise de microssatélites.

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
MEHRJOUY, MANA M.; FONSECA, ANA CAROLINA S.; EHMKE, NADJA; PASKULIN, GIORGIO; NOVELLI, ANTONIO; BENEDICENTI, FRANCESCO; MENCARELLI, MARIA ANTONIETTA; RENIERI, ALESSANDRA; BUSA, TIFFANY; MISSIRIAN, CHANTAL; HANSEN, CLAUS; ABE, KIKUE TERADA; SPECK-MARTINS, CARLOS EDUARDO; VIANNA-MORGANTE, ANGELA M.; BAK, MADS; TOMMERUP, NIELS. Regulatory variants of FOXG1 in the context of its topological domain organisation. European Journal of Human Genetics, v. 26, n. 2, p. 186-196, FEB 2018. Citações Web of Science: 1.
FONSECA, ANA CAROLINA S.; BONALDI, ADRIANO; FONSECA, SIMONE A. S.; OTTO, PAULO A.; KOK, FERNANDO; BAK, MADS; TOMMERUP, NIELS; VIANNA-MORGANTE, ANGELA M. The segregation of different submicroscopic imbalances underlying the clinical variability associated with a familial karyotypically balanced translocation. MOLECULAR CYTOGENETICS, v. 8, DEC 30 2015. Citações Web of Science: 2.
FONSECA, ANA CAROLINA S.; BONALDI, ADRIANO; BERTOLA, DEBORA R.; KIM, CHONG A.; OTTO, PAULO A.; VIANNA-MORGANTE, ANGELA M. The clinical impact of chromosomal rearrangements with breakpoints upstream of the SOX9 gene: two novel de novo balanced translocations associated with acampomelic campomelic dysplasia. BMC MEDICAL GENETICS, v. 14, MAY 7 2013. Citações Web of Science: 19.
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
ANA CAROLINA DOS SANTOS FONSECA. Caracterização de rearranjos cromossômicos citogeneticamente equilibrados associados a quadros clínicos. 2016. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Biociências São Paulo.

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