Sequenciamento de última geração de RNAm para análise em larga escala da expressão gênica durante a metamorfose das castas de Apis mellifera

• Processo: 12/12941-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2012
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2016
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Marcia Maria Gentile Bitondi
• Beneficiário: Michelle Prioli Miranda Soares
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 11/03171-5 - Análise causal do desenvolvimento de Apis mellifera: genes reguladores e redes hierárquicas de expressão gênica na especificação de tecidos e órgãos, AP.TEM
• Assunto(s): Transcriptoma Análise de sequência de RNA Metamorfose Apis mellifera Genética do desenvolvimento Castas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Apis mellifera | Castas | metamorfose | RNA seq | Transcriptoma | Genética e Biologia do Desenvolvimento

Resumo

A metamorfose dos insetos consiste na transformação de um organismo imaturo em uma forma sexualmente madura, e se caracteriza pela degeneração ou remodelação dos tecidos larvais, enquanto os tecidos dos adultos são formados e se diferenciam a partir de células precursoras localizadas em diferentes regiões do corpo da larva. De nosso conhecimento, análises em grande escala da expressão gênica durante a metamorfose foram realizadas somente em Drosophila utilizando-se microarrays de sequências de cDNA que representaram 30-40% do total de genes preditos do genoma deste inseto-modelo. Estamos propondo aqui uma análise mais abrangente da variação da expressão gênica durante a metamorfose da abelha social Apis mellifera e para isto, utilizaremos da metodologia RNA seq (high-throughput RNA sequencing) para sequenciamento do transcriptoma. Esta análise global tem por finalidade o screening de genes diferencialmente expressos durante etapas precisas da metamorfose. Permitirá ainda, com o auxílio de ferramentas de bioinformática: (1) agrupar estes genes em classes de acordo com potenciais funções, (2) proceder à busca de sítios comuns nas regiões promotoras, passíveis de regulação por fatores de transcrição ou hormônios, que indiquem redes de co-regulação, (3) estabelecer redes hierárquicas de expressão gênica atuantes na metamorfose. Mais ainda, propomos a utilização de operárias e rainhas neste tipo de abordagem, com a finalidade de investigar peculiaridades casta-específicas da atividade gênica durante a transformação da larva em adulto. Espera-se que esta abordagem revele o amplo panorama da genética molecular da metamorfose.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

MIRANDA SOARES, MICHELLE PRIOLI; PINHEIRO, DANIEL GUARIZ; DE PAULA FREITAS, FLAVIA CRISTINA; PAULINO SIMOES, ZILA LUZ; GENTILE BITONDI, MARCIA MARIA. Transcriptome dynamics during metamorphosis of imaginal discs into wings and thoracic dorsum in Apis mellifera castes. BMC Genomics, v. 22, n. 1, OCT 22 2021. (14/13136-0, 12/12941-1, 11/03171-5)