Cariótipo molecular e evolução cromossômica em Trypanosoma cruzi: análise sintênica entre isolados de diferentes linhagens do parasita

• Processo: 12/21713-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2012
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2013
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Parasitologia - Protozoologia de Parasitos
• Pesquisador responsável: José Franco da Silveira Filho
• Beneficiário: Caroline Cortez
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 11/51475-3 - Biologia molecular e celular do parasitismo por Trypanosoma cruzi, AP.TEM
• Assunto(s): Protozoologia Evolução cromossômica Eletroforese em gel de campo pulsado Cromossomos Cariótipo Trypanosoma cruzi Análise in silico Hibridização
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: cromossomos | Evolução Cromossômica | Pfge | sintenia cromossomica | Trypanosoma cruzi | Genomica Estrural

Resumo

No presente projeto, o cariótipo molecular de diferentes isolados de Trypanosoma cruzi, obtido por eletroforese de campo pulsado, será correlacionado com os mapas físico e genético pela hibridização com marcadores cromossomo - específicos identificados nos bancos de dados do genoma de T. cruzi. Recentemente, nós comparamos o padrão de hibridização de 120 marcadores cromossomo - específicos identificados in silico com as bandas cromossômicas separadas por PFGE do clone CL Brener e da cepa G. Esta análise mostrou que grandes blocos sintênicos são conservados entre os isolados, porém há quebra de sintenia devido à duplicação e/ou deleção, que também foram observados. Não sabemos se a preservação da sintenia foi acompanhada pela manutenção da colinearidade gênica em um fenômeno conhecido como mesosintenia. O objetivo do presente projeto é estender a análise sintênica para diferentes isolados T.cruzi ao nível cromossômico por hibridização das bandas cromossômicas com marcadores cromossomos-específico. Serão incluídos nesta análise os genes de 3 clones de T.cruzi que tiveram o genoma recentemente sequenciados (Sylvio X10.1, Dm28c e CL14) e 2 cepas das linhagens Tc III e Tc IV, pouco estudados do ponto de vista cromossômico. A inclusão de isolados sequenciados deverá auxiliar-nos a investigar a ocorrência da mesosintenia em Trypanosoma cruzi.(AU)