Incorporação de informações genômicas no desenvolvimento de índices econômicos para a seleção de bovinos leiteiros

• Processo: 12/15948-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2013
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2016
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Gerson Barreto Mourão
• Beneficiário: Juliana Petrini
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Bioestatística Genética quantitativa Marcador molecular Seleção genômica Indicadores econômicos Bovinos leiteiros Gado Holandês Desenvolvimento econômico
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: holandês | Índice de Seleção | marcadores moleculares | selecao genomica | Bioestatística e genética quantitativa

Resumo

Uma limitação no emprego de índices de seleção é a restrição dos mesmos a características de fácil mensuração relacionadas a herdabilidades altas. Nisto, o uso de ferramentas moleculares no desenvolvimento destes poderá acarretar em ganhos em acurácia e consequentemente, em resposta à seleção por meio da abrangência de um número maior de características e da incorporação de marcadores genéticos. Neste contexto, o objetivo deste projeto de pesquisa é incorporar informações genômicas no desenvolvimento de índices econômicos. Para tanto, serão empregados dados fenotípicos e genotípicos de características produtivas e funcionais de 2.000 vacas holandesas. Os índices econômicos serão construídos a partir de cinco objetivos de seleção (produção, qualidade, reprodução, saúde, manutenção) e três cenários de bonificação (por volume de leite, por produção de derivados e por qualidade nutricional). Os ponderadores econômicos serão estimados por meio da derivada parcial da função de lucro em relação a cada característica avaliada na média das demais. Duas abordagens serão empregadas na predição dos valores genéticos: a abordagem clássica e a abordagem genômica, na qual se substitui a matriz de relacionamentos por uma matriz modificada que combina informações genômicas e de pedigree. O modelo de predição para ambas as metodologias incluirá o efeito fixo dos grupos de contemporâneos, de dias em lactação e classe de lactação; os efeitos aleatórios genéticos aditivos e o efeito residual inerente às observações. Os métodos serão comparados quanto à predição dos valores genômicos, à classificação dos animais, erro quadrático médio e acurácia. Adicionalmente, a seleção de reprodutores entre os índices econômicos será avaliada através da correlação de posto, acurácia e resposta à seleção. (AU)

Publicações científicas

(10)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

PETRINI, JULIANA; SALGADO, RICARDO MENEZES; PETERSEN RODRIGUEZ, MARY ANA; MACHADO, PAULO FERNANDO; MOURAO, GERSON BARRETO. Machine learning methods for the prediction of milk fatty acid content. INTERNATIONAL JOURNAL OF DAIRY TECHNOLOGY, v. N/A, p. 10-pg., 2022-06-01. (10/12929-6, 12/15948-7)

PETRINI, JULIANA; DE SOUZA IUNG, LAIZA HELENA; PETERSEN RODRIGUEZ, MARY ANA; SALVIAN, MAYARA; ROVADOSCKI, GREGORI ALBERTO; ROBLES COLONIA, SADITT ROCIO; CASSOLI, LAERTE DAGHER; COUTINHO, LUIZ LEHMANN; MACHADO, PAULO FERNANDO; WIGGANS, GEORGE; et al. Assessing the accuracy of prediction for milk fatty acids by using a small reference population of tropical Holstein cows. JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, AUG 2019. (12/15948-7, 10/12929-6, 12/24788-3)

PETRINI, J.; IUNG, L. H. S.; RODRIGUEZ, M. A. P.; SALVIAN, M.; PERTILLE, F.; ROVADOSCKI, G. A.; CASSOLI, L. D.; COUTINHO, L. L.; MACHADO, P. F.; WIGGANS, G. R.; et al. Genetic parameters for milk fatty acids, milk yield and quality traits of a Holstein cattle population reared under tropical conditions. JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, v. 133, n. 5, p. 384-395, OCT 2016. (10/12929-6, 12/15948-7)

CARRARA, EULA REGINA; GAYA, LEILA DE GENOVA; PETRINI, JULIANA; DE PAIVA, JOSE TEODORO; SALVIAN, MAYARA; ROVADOSCKI, GREGORI ALBERTO; MACHADO, PAULO FERNANDO; MOURAO, GERSON BARRETO. Genetic and phenotypic trends for milk fatty acids in a Holstein cattle population reared under tropical conditions. LIVESTOCK SCIENCE, v. 228, p. 84-92, OCT 2019. (12/15948-7, 16/15066-5, 10/12929-6, 12/24788-3)

SALVIAN, MAYARA; SILVEIRA, ROBSON MATEUS FREITAS; PETRINI, JULINA; ROVADOSCKI, GREGORI ALBERTO; IUNG, LAIZA HELENA DE SOUZA; RAMIREZ-DIAZ, JOHANNA; CARRARA, EULA REGINA; PERTILE, SIMONE FERNANDA NEDEL; CASSOLI, LAERTE DAGHER; MACHADO, PAULO FERNANDO; et al. Heat stress on breeding value prediction for milk yield and composition of a Brazilian Holstein cattle population. INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOMETEOROLOGY, v. 67, n. 2, p. 8-pg., 2022-12-29. (12/15948-7, 10/12929-6, 12/24788-3)

IUNG, L. H. S.; PETRINI, J.; RAMIREZ-DIAZ, J.; SALVIAN, M.; ROVADOSCKI, G. A.; PILONETTO, F.; DAURIA, B. D.; MACHADO, P. F.; COUTINHO, L. L.; WIGGANS, G. R.; et al. Genome-wide association study for milk production traits in a Brazilian Holstein population. JOURNAL OF DAIRY SCIENCE, v. 102, n. 6, p. 5305-5314, JUN 2019. (12/24788-3, 10/12929-6, 12/15948-7)

CARRARA, EULA REGINA; PETRINI, JULIANA; SALVIAN, MAYARA; DE OLIVEIRA, HINAYAH ROJAS; ROVADOSCKI, GREGORI ALBERTO; IUNG, LAIZA HELENA DE SOUZA; MIQUILINI, MARINA; MACHADO, PAULO FERNANDO; MOURAO, GERSON BARRETO. Genetic parameters for milk yield and quality traits of Brazilian Holstein cows as a function of temperature and humidity index. JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, v. 138, n. 6, JUN 2021. (12/15948-7, 12/24788-3, 10/12929-6, 16/15066-5)

PETRINI, JULIANA; DE SOUZA IUNG, LAIZA HELENA; PETERSEN RODRIGUEZ, MARY ANA; SALVIAN, MAYARA; ROVADOSCKI, GREGORI ALBERTO; ROBLES COLONIA, SADITT ROCIO; CASSOLI, LAERTE DAGHER; COUTINHO, LUIZ LEHMANN; MACHADO, PAULO FERNANDO; WIGGANS, GEORGE; et al. Assessing the accuracy of prediction for milk fatty acids by using a small reference population of tropical Holstein cows. JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, v. 136, n. 6, p. 453-463, NOV 2019. (12/15948-7, 10/12929-6, 12/24788-3)

CARRARA, EULA REGINA; DAURIA, BRAYAN DIAS; GERVASIO, IZALLY CARVALHO; SILVEIRA, ROBSON MATEUS FREITAS; ROVADOSKI, GREGORI ALBERTO; PETRINI, JULIANA; SALVIAN, MAYARA; MACHADO, PAULO FERNANDO; MOURAO, GERSON BARRETO. Comparison of Marker Effects and Breeding Values at Two Levels at THI for Milk Yield and Quality Traits in Brazilian Holstein Cows. GENES, v. 14, n. 1, p. 11-pg., 2023-01-01. (12/15948-7, 10/12929-6, 16/15066-5, 12/24788-3)

CARRARA, EULA REGINA; GAYA, LEILA DE GENOVA; DE PAIVA, JOSE TEODORO; PETRINI, JULIANA; SALVIAN, MAYARA; ROVADOSCKI, GREGORI ALBERTO; REIS, ARICIA CHAVES ZANETTI; MACHADO, PAULO FERNANDO; MOURAO, GERSON BARRETO. Impact of inbreeding on milk fatty acids of a Brazilian Holstein cattle. ANIMAL PRODUCTION SCIENCE, v. 60, n. 12, APR 2020. (16/15066-5, 12/15948-7, 12/24788-3, 10/12929-6)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

PETRINI, Juliana. Incorporação de informações genômicas no desenvolvimento de índices econômicos para a seleção de bovinos leiteiros. 2016. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC) Piracicaba.