| Processo: | 13/12107-4 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 01 de outubro de 2013 |
| Data de Término da vigência: | 30 de setembro de 2016 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada |
| Pesquisador responsável: | Elsa Masae Mamizuka |
| Beneficiário: | John Anthony Mcculloch |
| Instituição Sede: | Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCF). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil |
| Assunto(s): | Staphylococcus aureus Microbiologia médica Vancomicina |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | célula única | resistência heterogênea | sequenciamento de genoma | Staphylococcus aureus | Vancomicina | Visa | Microbiologia Clínica |
Resumo A vancomicina é frequentemente a única alternativa contra infecções por S. aureus resistente a meticilina (MRSA). Cepas MRSA que não respondem ao tratamento com vancomicina são caracterizadas como resistentes (VRSA) ou intermediárias (VISA). Cepas com fenótipo VISA apresentam engrossamento da parede celular, o que pode ocorrer por conjuntos diferentes de mutações em vários genes. Ademais, certas linhagens apresentam o fenômeno de resistência heterogênea à vancomicina (hVISA), em subpopulações de uma única colônia apresentam concentrações inibitórias mínimas (CIMs) de vancomicina maiores que a mediana populacional total, o que pode levat a um resultado falso sensível no laboratório clínico. Essas subpopulações com CIMs maiores do que a maioria que não seriam detectadas por sequenciamento a partir de DNA extraído de uma massa de células obtidas por cultivo, já que genes não mutados dominariam a amostra. A presente proposta pretende usar uma abordagem de célula única (single cell) para identificar quais dos genes mutantes atribuídos ao fenótipo VISA encontram-se já presentes em todas as subpopulações de linhagens hVISA, e quais estão presentes em apenas algumas. Os genomas das células únicas hVISA isoladas por microdissecção a laser serão amplificados por MDA e sequenciados. O mesmo será feito com células de linhagens com fenótipo VISA e sensíveis à vancomicina (VSSA). O alinhamento dos scaffolds genômicos permitirá identificar polimorfismos nas sequências codificadoras entre subpopulações de cada linhagem hVISA, bem como entre essas e células de linhagens VISA e VSSA. | |
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