Análise metagenômica da microbiota periodontal subgengival em indivíduos com e sem doença periodontal

Resumo

A periodontite é uma doença infecciosa polimicrobiana apontada como um problema de saúde mundial pela OMS. A busca pelos fatores etiológicos associados à periodontite já dura mais de três séculos. Avanços recentes nas técnicas de diagnóstico microbiológico têm mostrado, com cada vez mais clareza a imensa complexidade da interação da microbiota oral com o hospedeiro. As novas técnicas de biologia molecular permitiram a detecção de microrganismos não cultiváveis em amostras de placa oral, levando a um grande avanço na compreensão da etiologia das infecções periodontais. Porém, a maioria dessas técnicas dependem da amplificação por PCR (polimerase chain reaction) de um marcador filogenético, tal como o 16S rDNA, o que tem gerado ampla discussão na literatura sobre limitações associadas a essa etapa inicial de amplificação. As técnicas de sequenciamento de nova geração permitem o sequenciamento direto de DNA metagenômico, diminuindo os vieses incorridos na clonagem gênica. Até o momento essa abordagem foi utilizada tem sido empregada em poucos estudos da microbiota oral, e apenas um deles avaliou indivíduos com saúde (n=3) ou doença periodontal (n=2). Os resultados desses estudos têm sugerido uma diversidade microbiana com ordens de grandeza maiores do que os encontrados nos estudos que utilizaram técnicas dependentes de PCR e clonagem. Sendo assim, o presente estudo pretende utilizar o sequenciamento direito de DNA metagenômico para avaliar detalhadamente a composição da placa subgengival associado à periodontite. Esse seria o primeiro estudo a utilizar essa técnica para avaliar individualmente (não em "pool") amostras de placa oral em indivíduos com saúde e doença periodontal.