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Análise metagenômica da microbiota periodontal subgengival em indivíduos com e sem doença periodontal

Processo: 12/20915-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de abril de 2013
Vigência (Término): 31 de março de 2016
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Odontologia - Periodontia
Pesquisador responsável:Magda Feres Figueiredo
Beneficiário:Paula Juliana Perez Chaparro
Instituição-sede: Universidade de Guarulhos (UNG). Campus Guarulhos-Centro. Guarulhos , SP, Brasil
Assunto(s):Microbiota   Diversidade   Metagenoma   Periodontite   Microbiologia

Resumo

A periodontite é uma doença infecciosa polimicrobiana apontada como um problema de saúde mundial pela OMS. A busca pelos fatores etiológicos associados à periodontite já dura mais de três séculos. Avanços recentes nas técnicas de diagnóstico microbiológico têm mostrado, com cada vez mais clareza a imensa complexidade da interação da microbiota oral com o hospedeiro. As novas técnicas de biologia molecular permitiram a detecção de microrganismos não cultiváveis em amostras de placa oral, levando a um grande avanço na compreensão da etiologia das infecções periodontais. Porém, a maioria dessas técnicas dependem da amplificação por PCR (polimerase chain reaction) de um marcador filogenético, tal como o 16S rDNA, o que tem gerado ampla discussão na literatura sobre limitações associadas a essa etapa inicial de amplificação. As técnicas de sequenciamento de nova geração permitem o sequenciamento direto de DNA metagenômico, diminuindo os vieses incorridos na clonagem gênica. Até o momento essa abordagem foi utilizada tem sido empregada em poucos estudos da microbiota oral, e apenas um deles avaliou indivíduos com saúde (n=3) ou doença periodontal (n=2). Os resultados desses estudos têm sugerido uma diversidade microbiana com ordens de grandeza maiores do que os encontrados nos estudos que utilizaram técnicas dependentes de PCR e clonagem. Sendo assim, o presente estudo pretende utilizar o sequenciamento direito de DNA metagenômico para avaliar detalhadamente a composição da placa subgengival associado à periodontite. Esse seria o primeiro estudo a utilizar essa técnica para avaliar individualmente (não em "pool") amostras de placa oral em indivíduos com saúde e doença periodontal.

Publicações científicas (10)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
PEREZ-CHAPARRO, PAULA JULIANA; MCCULLOCH, JOHN ANTHONY; MAMIZUKA, ELSA MASAE; LIMA MORAES, ALINE DA COSTA; FAVERI, MARCELO; FIGUEIREDO, LUCIENE CRISTINA; DUARTE, POLIANA MENDES; FERES, MAGDA. Do different probing depths exhibit striking differences in microbial profiles?. JOURNAL OF CLINICAL PERIODONTOLOGY, v. 45, n. 1, p. 26-37, JAN 2018. Citações Web of Science: 7.
PEREZ-CHAPARRO, PAULA JULIANA; DUARTE, POLIANA MENDES; SHIBLI, JAMIL AWAD; MONTENEGRO, SHEYLA; HELUY, SILVIA LACERDA; FIGUEIREDO, LUCIENE CRISTINA; FAVERI, MARCELO; FERES, MAGDA. The Current Weight of Evidence of the Microbiologic Profile Associated With Peri-Implantitis: A Systematic Review. Journal of Periodontology, v. 87, n. 11, p. 1295-1304, NOV 2016. Citações Web of Science: 17.
GONCALVES, CRISTIANE; SOARES, GEISLA MARY S.; FAVERI, MARCELO; PEREZ-CHAPARRO, PAULA JULIANA; LOBAO, EDUARDO; FIGUEIREDO, LUCIENE CRISTINA; BACCELLI, GUSTAVO TITONELE; FERES, MAGDA. Association of three putative periodontal pathogens with chronic periodontitis in Brazilian subjects. Journal of Applied Oral Science, v. 24, n. 2, p. 181-185, MAR-APR 2016. Citações Web of Science: 5.
RATTO-TESPESTINI, ANNA CAROLINA; PEREZ-CHAPARRO, PAULA JULIANA; ROMITO, GUISEPPE ALEXANDRE; FIGUEIREDO, LUCIENE CRISTINA; FAVERI, MARCELO; CARILLO, HILANA PAULA; LARCHER, PRISCILA; FERES, MAGDA. Comparison of independent and dependent culture methods for the detection of transient bacteremia in diabetic subjects with chronic periodontitis. BIOMEDICA, v. 36, n. 1, p. 156-161, MAR 2016. Citações Web of Science: 4.
MCCULLOCH, JOHN ANTHONY; DE OLIVEIRA SILVEIRA, ALESSANDRO CONRADO; LIMA MORAES, ALINE DA COSTA; PEREZ-CHAPARRO, PAULA JULIANA; SILVA, MANOELLA FERREIRA; ALMEIDA, LARA MENDES; D'AZEVEDO, PEDRO ALVES; MAMIZUKA, ELSA MASAE. Complete Genome Sequence of Staphylococcus aureus FCFHV36, a Methicillin-Resistant Strain Heterogeneously Resistant to Vancomycin. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 3, n. 4 JUL-AUG 2015. Citações Web of Science: 3.
ARETUZA FRITOLI; CRISTIANE GONÇALVES; MARCELO FAVERI; LUCIENE CRISTINA FIGUEIREDO; PAULA JULIANA PÉREZ-CHAPARRO; DAIANE FERMIANO; MAGDA FERES. The effect of systemic antibiotics administered during the active phase of non-surgical periodontal therapy or after the healing phase: a systematic review. Journal of Applied Oral Science, v. 23, n. 3, p. -, Jun. 2015.
DE ALMEIDA, LARA M.; PIRES, CARLOS; CERDEIRA, LOUISE T.; DE OLIVEIRA, THEO G. M.; MCCULLOCH, JOHN ANTHONY; PEREZ-CHAPARRO, PAULA JULIANA; SACRAMENTO, ANDREY G.; BRITO, ARTEMIR C.; DA SILVA, JOAS L.; DE ARAUJO, MARIA RITA E.; LINCOPAN, NILTON; MARTIN, MELISSA J.; GILMORE, MICHAEL S.; MAMIZUKA, ELSA M. Complete Genome Sequence of Linezolid-Susceptible Staphylococcus haemolyticus Sh29/312/L2, a Clonal Derivative of a Linezolid-Resistant Clinical Strain. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 3, n. 3 MAY-JUN 2015. Citações Web of Science: 2.
PEREZ-CHAPARRO, P. J.; DUARTE, P. M.; PANNUTI, C. M.; FIGUEIREDO, L. C.; MESTNIK, M. J.; GONCALVES, C. P. S.; FAVERI, M.; FERES, M. Evaluation of human and microbial DNA content in subgingival plaque samples collected by paper points or curette. Journal of Microbiological Methods, v. 111, p. 19-20, APR 2015. Citações Web of Science: 2.
PEREZ-CHAPARRO, P. J.; GONCALVES, C.; FIGUEIREDO, L. C.; FAVERI, M.; LOBAO, E.; TAMASHIRO, N.; DUARTE, P.; FERES, M. Newly Identified Pathogens Associated with Periodontitis: A Systematic Review. JOURNAL OF DENTAL RESEARCH, v. 93, n. 9, p. 846-858, SEP 2014. Citações Web of Science: 97.
PEREZ-CHAPARRO, PAULA JULIANA; CERDEIRA, LOUISE TEIXEIRA; QUEIROZ, MAISE GOMES; SILVA DE LIMA, CLAYTON PEREIRA; LEVY, CARLOS EMILIO; PAVEZ, MONICA; LINCOPAN, NILTON; GONCALVES, EVONNILDO COSTA; MAMIZUKA, ELSA MASAE; MELLO SAMPAIO, JORGE LUIZ; TEIXEIRA NUNES, MARCIO ROBERTO; MCCULLOCH, JOHN ANTHONY. Complete Nucleotide Sequences of Two bla(KPC-2)-Bearing IncN Plasmids Isolated from Sequence Type 442 Klebsiella pneumoniae Clinical Strains Four Years Apart. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, v. 58, n. 5, p. 2958-2960, MAY 2014. Citações Web of Science: 9.

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