Estudo de coexpressão de genes do cromossomo Y e genes autossômicos e sua relação com o transtorno do espectro autista (TEA)

• Processo: 14/00041-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2014
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2017
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Helena Paula Brentani
• Beneficiário: Ana Carolina Tahira
• Instituição Sede: Instituto de Psiquiatria Doutor Antonio Carlos Pacheco e Silva (IPq). Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da USP (HCFMUSP). Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Transtorno autístico Expressão gênica Cromossomo Y
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: autismo | Cromossomo Y | expressão gênica | matrix de coexpressão | Biologia Molecular/Bioinformática

Resumo

O transtorno do espectro autista (TEA) é uma doença do neurodesenvolvimento com alta frequência na população e apresenta um amplo espectro de severidade e prejuízos. Interessantemente, há uma distorção na taxa de prevalência entre meninos e meninas (4:1). Muitas hipóteses focando o dimorfismo sexual foram criadas a fim de explicar esta prevalência, entretanto o exato mecanismo que consiga explicar este quadro ainda é desconhecido. Recentemente, estudos feitos em Drosophila melanogaster mostraram que um conjunto de genes autossomos ou no cromossomo X apresentou diferença de expressão nos experimentos de introgressão do cromossomo Y. Em humanos, esta variação de expressão de genes autossômicos/X por genes ou transcritos mapeados no cromossomo Y ainda é muito pouco explorada. Neste sentido, este projeto tem como foco estudar se mudanças na expressão de genes do cromossomo Y são acompanhadas pelos genes localizados em outros cromossomos utilizando como base a construção de matrizes de coexpressão (WGCNA, implementado no R) utilizando amostras de dados públicos de microarranjos de indivíduos do sexo masculino. Ainda, pretende-se verificar se esta coexpressão é diferente na comparação entre indivíduos autistas e normais. Junto a esta proposta, ainda pretende-se identificar genes ortólogos humanos em D. Melanogaster que mostraram diferença de expressão devido aos diferentes cromossomos Y e verificar se este conjunto de genes humanos está enriquecido com genes associados ao autismo. Esta abordagem poderia sugerir efeito do cromossomo Y no autismo, criando perspectivas para as possíveis funções de genes no cromossomo Y, sendo um trabalho importante para melhor compreensão dos mecanismos envolvidos no TEA.

Publicações científicas

(9)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

TAHIRA, ANA; MARQUES, FERNANDA; LISBOA, BIANCA; FELTRIN, ARTHUR; BARBOSA, ANDRE; DE OLIVEIRA, KATIA CRISTINA; DE BRAGANCA PEREIRA, CARLOS ALBERTO; LEITE, RENATA; GRINBERG, LEA; SUEMOTO, CLAUDIA; et al. Are the 50's, the transition decade, in choroid plexus aging?. GEROSCIENCE, v. 43, n. 1, SI, FEB 2021. (14/10488-3, 14/00591-1, 14/00041-1, 11/14658-2)

CAMILO, CAROLINE; MASCHIETTO, MARIANA; VIEIRA, HENRIQUE C.; TAHIRA, ANA C.; GOUVEIA, GISELE R.; FEIO DOS SANTOS, ANA C.; NEGRAO, ANDRE B.; RIBEIRO, MARCELO; LARANJEIRA, RONALDO; VALLADA, HOMERO; et al. Genome-wide DNA methylation profile in the peripheral blood of cocaine and crack dependents. Revista Brasileira de Psiquiatria, v. 41, n. 6, p. 485-493, NOV-DEC 2019. (13/00659-2, 15/06281-7, 14/00041-1)

TAHIRA, ANA CAROLINA; BARBOSA, ANDRE ROCHA; FELTRIN, ARTHUR SANT'ANNA; GASTALDI, VINICIUS DAGUANO; CALEGARI DE TOLEDO, VICTOR HUGO; DE CARVALHO PEREIRA, JOSE GERALDO; GARCIA LISBOA, BIANCA CRISTINA; DE SOUZA REIS, VIVIANE NERI; FEIO DOS SANTOS, ANA CECILIA; MASCHIETTO, MARIANA; et al. Putative contributions of the sex chromosome proteins SOX3 and SRY to neurodevelopmental disorders. AMERICAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS PART B-NEUROPSYCHIATRIC GENETICS, v. 180, n. 6, SI, p. 390-414, SEP 2019. (14/00591-1, 14/10488-3, 15/06281-7, 11/14658-2, 14/00041-1, 11/04956-6)

FELTRIN, ARTHUR SANT'ANNA; TAHIRA, ANA CAROLINA; SIMOES, SERGIO NERY; BRENTANI, HELENA; MARTINS, JR., DAVID CORREA. Assessment of complementarity of WGCNA and NERI results for identification of modules associated to schizophrenia spectrum disorders. PLoS One, v. 14, n. 1, JAN 15 2019. (11/04956-6, 11/50761-2, 14/00041-1, 14/10488-3, 15/01587-0)

MASCHIETTO, MARIANA; TAHIRA, ANA C.; PUGA, RENATO; LIMA, LEANDRO; MARIANI, DANIEL; PAULSEN, BRUNA DA SILVEIRA; BELMONTE-DE-ABREU, PAULO; VIEIRA, HENRIQUE; KREPISCHI, ANA C. V.; CARRARO, DIRCE M.; et al. Co-expression network of neural-differentiation genes shows specific pattern in schizophrenia. BMC MEDICAL GENOMICS, v. 8, MAY 16 2015. (14/00041-1)

TAHIRA, ANA; MARQUES, FERNANDA; LISBOA, BIANCA; FELTRIN, ARTHUR; BARBOSA, ANDRE; DE OLIVEIRA, KATIA CRISTINA; DE BRAGANCA PEREIRA, CARLOS ALBERTO; LEITE, RENATA; GRINBERG, LEA; SUEMOTO, CLAUDIA; et al. Are the 50's, the transition decade, in choroid plexus aging?. GEROSCIENCE, v. 43, n. 1, p. 13-pg., 2021-02-12. (14/10488-3, 14/00041-1, 11/14658-2, 14/00591-1)

NERI DE SOUZA REIS, VIVIANE; TAHIRA, ANA CAROLINA; DAGUANO GASTALDI, VINICIUS; MARI, PAULA; PORTOLESE, JOANA; FEIO DOS SANTOS, ANA CECILIA; LISBOA, BIANCA; MARI, JAIR; CAETANO, SHEILA C.; BRUNONI, DECIO; et al. Environmental Influences Measured by Epigenetic Clock and Vulnerability Components at Birth Impact Clinical ASD Heterogeneity. GENES, v. 12, n. 9, SEP 2021. (14/00041-1, 12/51584-0, 14/00591-1, 11/14658-2)

CAMILO, CAROLINE; MASCHIETTO, MARIANA; VIEIRA, HENRIQUE C.; TAHIRA, ANA C.; GOUVEIA, GISELE R.; FEIO DOS SANTOS, ANA C.; NEGRAO, ANDRE B.; RIBEIRO, MARCELO; LARANJEIRA, RONALDO; VALLADA, HOMERO; et al. Genome-wide DNA methylation profile in the peripheral blood of cocaine and crack dependents. Revista Brasileira de Psiquiatria, v. 41, n. 6, p. 9-pg., 2019-11-01. (15/06281-7, 14/00041-1, 13/00659-2)

TAHIRA, ANA CAROLINA; BARBOSA, ANDRE ROCHA; FELTRIN, ARTHUR SANT'ANNA; GASTALDI, VINICIUS DAGUANO; CALEGARI DE TOLEDO, VICTOR HUGO; DE CARVALHO PEREIRA, JOSE GERALDO; GARCIA LISBOA, BIANCA CRISTINA; DE SOUZA REIS, VIVIANE NERI; FEIO DOS SANTOS, ANA CECILIA; MASCHIETTO, MARIANA; et al. Putative contributions of the sex chromosome proteins SOX3 and SRY to neurodevelopmental disorders. AMERICAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS PART B-NEUROPSYCHIATRIC GENETICS, v. 180, n. 6, p. 25-pg., 2019-09-01. (14/00591-1, 15/06281-7, 14/00041-1, 11/04956-6, 14/10488-3, 11/14658-2)