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Validação da expressão de pequenos peptídeos em Halobacterium salinarum por meio de cromossomal tagging

Processo: 14/24087-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de janeiro de 2015
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2015
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Tie Koide
Beneficiário:André Bordinassi Medina
Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:09/09532-0 - Biologia sistêmica do extremófilo Halobacterium salinarum: contribuição dos RNAs não-codificantes ao modelo global de regulação gênica, AP.JP
Assunto(s):Halobacterium salinarum   Peptídeos

Resumo

O desenvolvimento científico alcançado nos últimos anos tem permitido a obtenção e análise de dados biológicos de forma mais ampla e integrada, fazendo surgir uma nova área do estudo científico, chamada de biologia sistêmica, que reúne diversas áreas da ciência. A utilização desta abordagem permitiu, por exemplo, a descoberta de diversas regiões genômicas codificadoras de pequenas proteínas e peptídeos (smORFs) que eram até então negligenciadas ou em alguns casos, chamadas erroneamente de RNA não codificantes (ncRNA). Tais descobertas levaram a diversos estudos sobre as funções biológicas destes peptídeos, que demonstraram possuir importantes papéis regulatórios nas células de organismos em todos os domínios da vida. Assim, o presente estudo visa a utilização da haloarquea Halobacterium salinarum, um importante modelo no estudo sistêmico de organismos halófilos, na busca por novos peptídeos e pequenas proteínas. Essa hipótese será comprovada por meio da validação da expressão gênica através da técnica da marcação cromossômica (cromossomal tagging) dos genes candidatos, obtidos com o auxílio de dados de bioinformática e espectrometria de massas, atualmente em curso no Laboratório de Biologia Sistêmica de Microorganismos.