Validação da expressão de pequenos peptídeos em Halobacterium salinarum por meio de cromossomal tagging

• Processo: 14/24087-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2015
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2015
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Tie Koide
• Beneficiário: André Bordinassi Medina
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 09/09532-0 - Biologia sistêmica do extremófilo Halobacterium salinarum: contribuição dos RNAs não-codificantes ao modelo global de regulação gênica, AP.JP
• Assunto(s): Biologia computacional Biologia sistêmica Microbiologia Halobacterium salinarum Peptídeos RNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cromossomal tagging | Halobacterium salinarum | peptídeos | Pequenas proteínas | smORFs | Biologia sistêmica / microbiologia

Resumo

O desenvolvimento científico alcançado nos últimos anos tem permitido a obtenção e análise de dados biológicos de forma mais ampla e integrada, fazendo surgir uma nova área do estudo científico, chamada de biologia sistêmica, que reúne diversas áreas da ciência. A utilização desta abordagem permitiu, por exemplo, a descoberta de diversas regiões genômicas codificadoras de pequenas proteínas e peptídeos (smORFs) que eram até então negligenciadas ou em alguns casos, chamadas erroneamente de RNA não codificantes (ncRNA). Tais descobertas levaram a diversos estudos sobre as funções biológicas destes peptídeos, que demonstraram possuir importantes papéis regulatórios nas células de organismos em todos os domínios da vida. Assim, o presente estudo visa a utilização da haloarquea Halobacterium salinarum, um importante modelo no estudo sistêmico de organismos halófilos, na busca por novos peptídeos e pequenas proteínas. Essa hipótese será comprovada por meio da validação da expressão gênica através da técnica da marcação cromossômica (cromossomal tagging) dos genes candidatos, obtidos com o auxílio de dados de bioinformática e espectrometria de massas, atualmente em curso no Laboratório de Biologia Sistêmica de Microorganismos.