Sequenciamento de alto desempenho para quantificação da doença residual mínima em leucemia linfóide aguda

• Processo: 17/03942-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2018
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2019
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina
• Acordo de Cooperação: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
• Pesquisador responsável: José Andrés Yunes
• Beneficiário: Guilherme Navarro Nilo Giusti
• Instituição Sede: Centro Infantil de Investigações Hematológicas Dr Domingos A Boldrini (CIB). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Sequenciamento de nova geração Oncologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: cancer pediátrico | Doença residual mínima | Leucemia linfoide aguda | linfocito B | Rearranjo V(D)J | sequenciamento de nova geração | Oncologia

Resumo

A leucemia linfóide aguda (LLA) é o câncer mais comum na criança. Os atuais protocolos de tratamento da LLA pediátrica alcançam um índice de sobrevida livre de doença maior que 70%. Parte do sucesso se deve à alocação dos pacientes em diferentes grupos de risco, segundo fatores prognósticos pré-tratamento. A resposta inicial ao tratamento, avaliada pela quantificação de células leucêmicas residuais, ou doença residual mínima (DRM), é um dos mais importantes fatores para a identificação desses grupos de risco. O atual protocolo do Grupo Brasileiro de Tratamento da Leucemia Infantil (GBTLI LLA-2009), usa a DRM dos dias 15 e 35 do tratamento, avaliada por citometria de fluxo e por PCR quantitativo (RQ-PCR), para realocação dos pacientes nos grupos para diferentes esquemas de tratamento quimioterápico. A avaliação da DRM por citometria de fluxo (DRM-CF) e RQ-PCR (DRM-PCR) são métodos caros, exigem muita experiência e demandam análise imediata (citometria) ou demorada das amostras (RQ-PCR), dificultando seu uso em abrangência nacional. O número de crianças que tem se beneficiado do exame de DRM é de apenas 100 por ano (3,5%). Nesse projeto pretende-se padronizar o uso do sequenciamento de última geração para a quantificação da DRM em crianças com LLA, com vantagens em termos de custos, rapidez e escalabilidade. Uma vez padronizado, o método de análise de DRM por sequenciamento (DRM-seq) será validado em amostras retrospectivas do Centro Boldrini. Resultados de DRM-seq serão comparados com resultados de DRM-PCR para as mesmas amostras. Espera-se estabelecer um método mais propício à universalização do exame da DRM para todas as crianças com LLA do Brasil. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

GIUSTI, GUILHERME NAVARRO NILO; JOTTA, PATRICIA YOSHIOKA; LOPES, CAROLINE DE OLIVEIRA; GANAZZA, MONICA APARECIDA; AZEVEDO, AMILCAR CARDOSO; BRANDALISE, SILVIA REGINA; MEIDANIS, JOAO; YUNES, JOSE ANDRES. Test trial of spike-in immunoglobulin heavy-chain (IGH) controls for next generation sequencing quantification of minimal residual disease in acute lymphoblastic leukaemia. British Journal of Haematology, v. 189, n. 4, MAR 2020. (18/00031-7, 17/03942-8)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

GIUSTI, Guilherme Navarro Nilo. Sequenciamento de alto desempenho para quantificação da doença residual mínima em leucemia linfoide aguda. 2019. Dissertação de Mestrado - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Biologia Campinas, SP.